ここにあなたが望むと思うことをする方法があります
In [34]: df = read_csv(StringIO(data),sep='\s+')
datelike-index を作成します (ここでは秒を意味すると仮定します。日付に追加するには ns に変換する必要があります)
In [35]: df['time'] = pd.to_datetime([Timestamp('20130101').value + v*1e9 for v in df['time'] ])
In [36]: df.set_index('time',inplace=True)
In [37]: df
Out[37]:
value
time
2013-01-01 00:00:00 0.0000
2013-01-01 00:00:00.012999 0.0134
2013-01-01 00:00:00.023000 0.0256
2013-01-01 00:00:00.035000 0.0423
2013-01-01 00:00:00.048999 0.0756
2013-01-01 00:00:00.068999 0.0998
結果を 20 ミリ秒に合わせ、最小値なしで 20 周期をローリングします
In [38]: pd.rolling_sum(df,20,0,freq='20ms')
Out[38]:
value
time
2013-01-01 00:00:00 0.00670
2013-01-01 00:00:00.020000 0.04065
2013-01-01 00:00:00.040000 0.11625
2013-01-01 00:00:00.060000 0.21605