2 つの iframe を使用する必要があります。1 つは IE8 用で、もう 1 つは残りのブラウザー用です。angularjs スコープ変数 (myUrl) が後の iframe で評価されていることがわかりますが、最初の iframe では評価されていません。
<div id="frameContainer" class="modal-body ios-scroll">
<!--[if IE 8]><iframe ng-src="{{myUrl}}?domain=http://localhost:9001/" class="signInIframe" frameborder="0" marginheight="0" marginwidth="0" height="620" width="600"></iframe> <![endif]-->
<!--[if (gt IE 8)|!(IE)]><!--> <iframe ng-src="{{myUrl}}?domain=http://localhost:9001/" class="signInIframe" frameborder="0" marginheight="0" marginwidth="0" height="100%" width="100%"></iframe><!--<![endif]-->
</div>