MainStoryboard.storyboard を Xcode 4 から Xcode 5 にアップグレードした後、プロジェクトがコンパイルされなくなり、停止するだけです。また、Activity Monitor を見ると、Interface Builder Cocoa Touch Tool がすべての CPU とメモリのパワーを要求していることがわかります。このプロセスを強制終了することが、xcode のコンパイルをさらに停止させる唯一の方法です。
Xcode がコンパイルで停止したときに記録されたかなり長いコンソール ログ ファイルを次に示します: http://pastebin.com/c9q1yGuy