分光ピークを見つけるためにいくつかのスペクトルを分析しようとしています。見つけたいピークの前後をクリックして、2 つの X データ間の最大 Y 値 (ピーク) を見つけるためのこの単純なコードを作成しました。これは機能し、ピークの座標を取得できますが、見つかったピークに自動的に注釈を付けたいと思います。
import matplotlib.pyplot as plt
X=[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10]
Y=[1,1,1,2,10,2,1,1,1,1]
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111)
ax.plot(X,Y,label="prova") #plot the function
#plt.legend(loc=1, ncol=1, shadow=True)
plt.xlim(min(X) * 0.9, max(X) * 1.1)
plt.ylim(min(Y) * 0.9, max(Y) * 1.1)
plt.ylabel(r'Y axis')
plt.xlabel(r'X axis')
Diz=dict(zip(X,Y)) #create a dictionary that associate X with Y
Interval=[] #interval where the user search for peaks
PeaksList=[] #list of peaks found
def onclick(event):
print 'First limit at =%f'%(event.xdata)
Interval.append(event.xdata)
if len(Interval)%2==0:
a=Interval[-2]
b=Interval[-1]
if b<a: #if the user select first the highest value these statements filp it!
A=b
B=a
else:
A=a
B=b
#find the max Y value: the peak!
peakY=0 #max Y value
piccoX=0 #value of the X associate to the peak
for i in [ j for j in X if A<j<B] :
if Diz[i]>peakY:
peakY=Diz[i]
piccoX=i
print "Interval: %f - %f Peak at: %f " %(a,b,piccoX)
PeaksList.append([piccoX,peakY])
ax.annotate("picco", xy=(piccoX,peakY), xycoords='data',
xytext=(-50, 30), textcoords='offset points',
arrowprops=dict(arrowstyle="->")
)
plt.show()
cid = fig.canvas.mpl_connect('button_press_event', onclick)
これは、2回目のクリック後にしたいことです: