r - Rscript が関数を見つけられませんでした

Question

を使用してbashシェルを介していくつかのスクリプトを実行Rscriptする必要があり、使用する一部の機能には関数が必要ですisGeneric。ただし、この場合、プロセスは次のように終了します (例):

Error in .getLogLik() : could not 
find function "isGeneric"
Calls: main -> dredge -> .getLik -> .getLogLik
Execution halted

これは次のように再現できます

# in the bash shell
echo "isGeneric('apply')" > /tmp/test.R
Rscript /tmp/test.R

結果：

Error: could not find function "isGeneric"
Execution halted

ただし、R セッションを開いて次のように入力すると、機能します。

# in the R shell
isGeneric('apply')
[1] FALSE

問題がどこから来て、それを修正する方法を知っていますか?

score 23 · Accepted Answer

によるとhelp(Rscript)、Rscript時間がかかるため、デフォルトではメソッドパッケージをロードしません。したがって、コマンドラインで指定する必要があります。

Rscript --default-packages=methods file.R

またはlibrary(methods)、呼び出しているファイルの先頭にあります。

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