Slidebook v4.2 から Matlab に .spl ファイルをインポートしようとしていますが、問題が発生しました。
ここから関数と loci_tools.jar をダウンロードしました。私はそれらを使用して、小さな問題のあるファイルをインポートしました (Z 平面と時間ポイントが逆になり、間違った取得チャネルでいくつかのファイルの名前が間違っていました) が、問題のパターンを理解し、回避することができました彼ら。
次に、別のファイルをインポートしようとしましたが、解決できなかったこのエラーが発生しました。どんなアイデアでも大歓迎です。私はmatlabでJavaとJavaを扱うのが初めてです。これが私が得るエラーです：
I = bfopen(‘filename.spl’);
Finding offsets to pixel data
Determining dimensions
Reading series #1
.Error using loci.formats.ChannelSeparator/openBytes
Java exception occurred:
java.lang.IllegalArgumentException: Negative position
at sun.nio.ch.FileChannelImpl.read(FileChannelImpl.java:600)
at loci.common.NIOByteBufferProvider.allocateDirect(NIOByteBufferProvider.java:133)
at loci.common.NIOByteBufferProvider.allocate(NIOByteBufferProvider.java:118)
at loci.common.NIOFileHandle.buffer(NIOFileHandle.java:532)
at loci.common.NIOFileHandle.seek(NIOFileHandle.java:254)
at loci.common.RandomAccessInputStream.seek(RandomAccessInputStream.java:140)
at loci.formats.in.SlidebookReader.openBytes(SlidebookReader.java:130)
at loci.formats.ImageReader.openBytes(ImageReader.java:414)
at loci.formats.ChannelFiller.openBytes(ChannelFiller.java:197)
at loci.formats.ChannelSeparator.openBytes(ChannelSeparator.java:226)
at loci.formats.ChannelSeparator.openBytes(ChannelSeparator.java:159)
Error in bfGetPlane (line 75)
plane = r.openBytes(iPlane - 1, ip.Results.x - 1, ip.Results.y - 1, ...
Error in bfopen (line 144)
arr = bfGetPlane(r, i, varargin{:});