emacs で (ssh トンネル化され、sshfs マウントされたファイル システムを介して) ファイルを開くと、次のようなシンボリック リンクが表示されます。
.#jobid.php -> ddh@localhost.localdomain.31678:1260471633
これらは emacs LOCK ファイルであると判断しました。
sshfs ファイルシステムは follow_symlinks と transform_symlinks でマウントされていますが、readlink 経由でリンク「テキスト」を返すことを拒否しているように見えるため、emacs はそれらを削除していません。