MSVS2013 Update 4 および EF 6.0 でもこの問題が発生しています。メッセージは次のとおりです。
there was an error running the selected code generator.
A configuration for type XXXX has already been added ...[]
約10クラスのモデルがあります。プロジェクトの開始時に要素を問題なく足場にしました。
機能を追加してから数日後、モデルから別のクラスをスキャフォールディングしようとしましたが、エラーが発生して実行できませんでした。
MSVS を update 2 から update 4 に更新しようとしましたが、OnModelCreating メソッドや提案されたその他のアイデアをコメントアウトして運がありませんでした。
プロジェクトを続行するための一時的な方法として、別の asp.net プロジェクトを作成し、そこにモデル クラスを貼り付け (流暢な API を使用しているため、注釈はほとんどありません)、コントローラーとビューを正常に作成しました。
その後、作成したクラスを元のプロジェクトに貼り付け、いくつかの間違い (主に dbset 名) を修正しました。
動作しているようですが、クラス間の関係に関連する間違いがまだ見つかると思います (作成時の構成が流暢でないため)。
これが他のユーザーに役立つことを願っています。