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これは少し複雑で、これは初心者のエラーであると確信していますが、どこを見ればいいのかわからないのです。

多数のファイルを処理するためにマルチプロセッシング map_async を実行しようとしています。基本的に、コードはファイルのリストを取得し、各ファイルで一致する MAC アドレスを探し、一致する場合は別のファイルに行を書き出します。

nodb は私のライブラリです....ここにはまだすべてを含めていません (ちょっと複雑です)。誰かがこれをデバッグする場所を教えてくれることを願っています。

ここに問題があります。コードは 60,000 個未満のファイルに対して完全に機能します。ただし、595,200 個のファイルがあるディレクトリを指すと、(_number_left を使用して) 完了したかどうかを確認する小さな「while true」ループが機能しなくなります....処理は続行しているように見えますが、_number_left は減少せず、 ready() 関数は TRUE を返します...そうではありません。

そして、実行するたびに62111または62112のファイルを処理した後に停止します。キューがいっぱいになっていると思って、小さな「ダンプ」機能を追加しました。

他に何を言うべきかわからない...何か足りないのですか?(おそらく)これを理解するために、さらに何を伝えられるか教えてください。何が関係あるのかさっぱりわからない……。

コードは次のとおりです。

import nodb_v09d as nodb

import netaddr
import sys
import collections
from multiprocessing import Pool, Queue
import itertools
import time

# Handle CLI arguments
#
nmultip = 1
args = sys.argv[1:]
nmultip = nodb.parseArgs(args)

# this function just gets the file list in the directory
todoPif = nodb.getFileList('/data/david/data/2012/05')

filterfields = { 10:set([int(netaddr.EUI('00-00-0a-0e-c9-be')),\
                         int(netaddr.EUI('00:15:ce:de:78:f3')),\
                         int(netaddr.EUI('3c-75-4a-ea-15-01')),\
                         int(netaddr.EUI('00-24-d1-1e-e9-be'))])
                 }
ff=collections.OrderedDict(sorted(filterfields.items()))

resultfields = [28,29,30,33]
rf=resultfields.sort

cutoff = 40

todocnt = len(todoPif)

outQ = Queue()
hdrQ = Queue()

# output file
gpif = '/media/sf_samplePifs/test2.gpif'

append = 0

if __name__ == '__main__':

    # this is a little trick I picked up off the internet for passing multiple queues.  works ok
    todopool = Pool(None,nodb.poolQueueInit,[outQ,hdrQ])

    # itertools used to create an arg that contains a constant (ff) for all calls)
    r = todopool.map_async(nodb.deRefCall,itertools.izip(todoPif, itertools.repeat(ff)),1)

    while (True):
        nodb.logging.info('number left: ' + str(r._number_left) + '\nready? ' + str(r.ready()))
        nodb.logging.info('queue size: ' + str(outQ.qsize()))

        if (r._number_left == 0): break
        if (outQ.qsize() >= cutoff):
            nodb.dumpQueueToGpif(gpif, hdrQ, outQ, append, cutoff)
            if (append == 0): 
                append = 1

        sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt-r._number_left) + '/' + str(todocnt))
        print '\n'
        time.sleep(0.2)
    r.wait()  

sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt) + '/' + str(todocnt) + '\n')

# dump remainder to file
nodb.dumpQueueToGpif(gpif, hdrQ, outQ, append,outQ.qsize())

主な追加事項:

別のユーザーのリクエストで、コードを単純化しました。キューなし、外部プライベート ライブラリなしなど:

import sys
import os
import time
from multiprocessing import Pool

def doPifFile(pifFile):

    #readPif = call(['ls','-l',' > /tmp/out'])
    cmd = 'ipdr_dump ' + pifFile + ' | grep "," | wc -l > /tmp/dump'
    readPif = os.system(cmd)
    return readPif

def getFileList(directory):
    flist = list()
    for root, dirs, files in os.walk(directory):
        for piffile in files:
            if piffile.endswith('.pif'):
                flist.append(os.path.abspath(os.path.join(root,piffile)))
    return flist

todoPif = getFileList('/data/david/data/2012/05')

todocnt = len(todoPif)
print '# of files to process: ' + str(todocnt)

if __name__ == '__main__':

    todopool = Pool()
    r = todopool.map_async(doPifFile,todoPif,1)

    while (True):
        print 'number left: ' + str(r._number_left) + '\nready? ' + str(r.ready())

        #if (r.ready()): break
        if (r._number_left == 0): break
        sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt-r._number_left) + '/' + str(todocnt))
        print '\n'
        time.sleep(0.2)

sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt) + '/' + str(todocnt) + '\n')

私がそれを実行したとき、より複雑なコードでの実行では表示されなかった非常に興味深いものが得られましたが、それはまったく同じ場所で発生しましたが、それは私のダンププログラムで発生したと主張しています:

number left: 533100
ready? False
PIF Files DONE: 62100/595200

number left: 533090
ready? False
PIF Files DONE: 62110/595200

*** glibc detected *** ipdr_dump: corrupted double-linked list: 0x0000000001a58370 ***
======= Backtrace: =========
/lib64/libc.so.6[0x36f5c76126]
/lib64/libc.so.6[0x36f5c78eb4]
/lib64/libc.so.6(fclose+0x14d)[0x36f5c6678d]
/lib64/libz.so.1[0x36f6803021]
ipdr_dump[0x405c0b]
ipdr_dump[0x40546e]
ipdr_dump[0x401c2a]
/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xfd)[0x36f5c1ecdd]
ipdr_dump[0x4016b9]
======= Memory map: ========
00400000-0040e000 r-xp 00000000 08:02 2364135                            /home/david/ipdr_dump
0060d000-0060e000 rw-p 0000d000 08:02 2364135                            /home/david/ipdr_dump
01a54000-01a75000 rw-p 00000000 00:00 0                                  [heap]
32e0600000-32e0604000 r-xp 00000000 08:02 3932181                        /lib64/libuuid.so.1.3.0
32e0604000-32e0803000 ---p 00004000 08:02 3932181                        /lib64/libuuid.so.1.3.0
32e0803000-32e0804000 rw-p 00003000 08:02 3932181                        /lib64/libuuid.so.1.3.0
36f5800000-36f5820000 r-xp 00000000 08:02 3932309                        /lib64/ld-2.12.so
36f5a1f000-36f5a20000 r--p 0001f000 08:02 3932309                        /lib64/ld-2.12.so
36f5a20000-36f5a21000 rw-p 00020000 08:02 3932309                        /lib64/ld-2.12.so
36f5a21000-36f5a22000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f5c00000-36f5d8a000 r-xp 00000000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5d8a000-36f5f89000 ---p 0018a000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5f89000-36f5f8d000 r--p 00189000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5f8d000-36f5f8e000 rw-p 0018d000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5f8e000-36f5f93000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f6000000-36f6002000 r-xp 00000000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6002000-36f6202000 ---p 00002000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6202000-36f6203000 r--p 00002000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6203000-36f6204000 rw-p 00003000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6400000-36f6417000 r-xp 00000000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6417000-36f6617000 ---p 00017000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6617000-36f6618000 r--p 00017000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6618000-36f6619000 rw-p 00018000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6619000-36f661d000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f6800000-36f6815000 r-xp 00000000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6815000-36f6a14000 ---p 00015000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6a14000-36f6a15000 r--p 00014000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6a15000-36f6a16000 rw-p 00015000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6c00000-36f6c83000 r-xp 00000000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f6c83000-36f6e82000 ---p 00083000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f6e82000-36f6e83000 r--p 00082000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f6e83000-36f6e84000 rw-p 00083000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f7000000-36f7007000 r-xp 00000000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7007000-36f7206000 ---p 00007000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7206000-36f7207000 r--p 00006000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7207000-36f7208000 rw-p 00007000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7800000-36f781d000 r-xp 00000000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f781d000-36f7a1c000 ---p 0001d000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f7a1c000-36f7a1d000 r--p 0001c000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f7a1d000-36f7a1e000 rw-p 0001d000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f7a1e000-36f7a1f000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f7c00000-36f7c16000 r-xp 00000000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7c16000-36f7e16000 ---p 00016000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7e16000-36f7e17000 r--p 00016000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7e17000-36f7e18000 rw-p 00017000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7e18000-36f7e1a000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f8000000-36f800e000 r-xp 00000000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f800e000-36f820d000 ---p 0000e000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f820d000-36f820e000 r--p 0000d000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f820e000-36f820f000 rw-p 0000e000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f8800000-36f8849000 r-xp 00000000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8849000-36f8a49000 ---p 00049000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8a49000-36f8a4b000 r--p 00049000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8a4b000-36f8a4d000 rw-p 0004b000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8c00000-36f8c16000 r-xp 00000000 08:02 3936000                        /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1
36f8c16000-36f8e15000 ---p 00016000 08:02 3936000                        /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1
36f8e15000-36f8e16000 rw-p 00015000 08:02 3936000                        /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1
36f9400000-36f9535000 r-xp 00000000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f9535000-36f9734000 ---p 00135000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f9734000-36f9739000 r--p 00134000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f9739000-36f973b000 rw-p 00139000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f973b000-36f973d000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f9800000-36f9825000 r-xp 00000000 08:02 4206135                        /usr/lib64/libnssutil3.so
36f9825000-36f9a24000 ---p 00025000 08:02 4206135                        /usr/lib64/libnssutil3.so
36f9a24000-36f9a2a000 r--p 00024000 08:02 4206135                        /usr/lib64/libnssutil3.sonumber left: 533078
ready? False
PIF Files DONE: 62122/595200

number left: 533068
ready? False
PIF Files DONE: 62132/595200

number left: 533056
ready? False
PIF Files DONE: 62144/595200

奇妙なことに、以前の実行では _number_left が失敗し、「ready()」で不発が発生しました (ただし、プロセスはバックグラウンドで実行されていました)。

私が持っている 16 プロセッサ ボックスでダンプ プログラムを手動で実行したところ、それらは正常に並列実行され、以前にその glibc エラーを見たことはありませんでした。私はそれがPythonのセットアップに関連付けられていると仮定する必要があります....どこにあるのかわかりません。

これは、フォーラムの診断には複雑すぎる可能性があります。私がどこを見ているのか、または何が起こったのかをどのように見せることができるのかについてのさらなるアイデアは大歓迎です.

もう 1 つ情報が... pool._success が出力されました。_number_left の動きが止まる魔法の瞬間に FALSE に変わります。

INFO  number left: 533167  
ready? False  
successful? True  
INFO  queue size: 424  
PIF Files DONE: 62033/595200  

INFO  number left: 533117
ready? False
successful? True
INFO  queue size: 424
PIF Files DONE: 62083/595200

INFO  number left: 533087
ready? True
successful? False
INFO  queue size: 424
PIF Files DONE: 62113/595200

INFO  number left: 533087
ready? True
successful? False
INFO  queue size: 424
PIF Files DONE: 62113/595200
4

2 に答える 2

1

苦労の末、私は問題を発見しました....問題の原因については、まだわかりません。バグのように見えます。

ここにいくつかの高レベルのコマンドがあるので、次に説明することはより理にかなっています (これは実行可能にするためのものではありません)。

todopool = Pool()

r = todopool.map_async(myfunction,args,1)

print type(r._value)

args が 595,200 個のファイル名のリストであることを思い出してください。

r._value を調べ始めました。私の場合は長さ 595,200 のリストです。問題が発生した時点で、値が変更されたことに気付きました....それで、型を調べました。

最近の実行からの出力は次のとおりです。

INFO  number left: 533148 <- based on r._number_left
<type 'list'>             <- print type(r._value)
PIF Files DONE: 62052/595200

INFO  number left: 533096
<type 'list'>
PIF Files DONE: 62104/595200

INFO  number left: 533087
<class 'nodb_v09e.pifReaderEOFReached'>
PIF Files DONE: 62113/595200

INFO  number left: 533087
<class 'nodb_v09e.pifReaderEOFReached'>
PIF Files DONE: 62113/595200

突然、長さ 595,200 のリストであった r._value が例外クラスになりました。奇妙なことに、私のサブルーチンのすべての実行はその例外で終わるため、この特定の実行は他の実行と何ら変わりはありません...これは、私がファイルの最後にいることを伝える方法です。

リストからクラスへの r._value の変更は、 _number_left と私の結果のフィードバック表示を台無しにするものです。なぜそれが行われるのかは不明です。

于 2013-11-15T05:32:43.690 に答える
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sys.stdout.flush() を試すことができます。

于 2013-11-14T07:47:29.893 に答える