2

更新近づいています。今、モジュールを生成するファイルを実行f2pyしています。.pyf_glmnet

次のコマンドを使用して、パッケージpython-glmnetパケットをビルドします。

python setup.py config_fc --fcompiler=gnu95         
                                           --f77flags='-fdefault-real-8'         
                                          --f90flags='-fdefault-real-8' build

しかし、モジュールをインポートすると、次のエラーが発生します。

ファイル "/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet/glmnet.py"、2 行目、インポート _glmnet の ImportError: No module named _glmnet

そのモジュールをインポートするにはどうすればよいですか?

glmnet ディレクトリにはglmnet.pyf、次で始まるファイルも含まれています。

!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module _glmnet ! in
    interface  ! in :_glmnet
        subroutine elnet(ka,parm,no,ni,x,y,w,jd,vp,ne,nx,nlam,flmin,ulam,thr,isd,lmu,a0,ca,ia,nin,rsq,alm,nlp,jerr) ! in :glmnet:glmnet.f
            integer optional :: ka=1 ! Use covariance updates over naive by default
            real*8 :: parm
            integer intent(hide),check(shape(x,0)==no),depend(x) :: no=shape(x,0)
            integer intent(hide),check(shape(x,1)==ni),depend(x) :: ni=shape(x,1)
            real*8 dimension(no,ni) :: x
            real*8 dimension(no),depend(no) :: y
            real*8 dimension(no),depend(no) :: w
            integer dimension(*) :: jd
            real*8 dimension(ni),depend(ni) :: vp
            integer optional,depend(x) :: ne=min(shape(x,1), nx)
            integer :: nx
            integer optional,check((flmin < 1.0 || len(ulam)==nlam)),depend(flmin,ulam) :: nlam=len(ulam)
            real*8 :: flmin
            real*8 dimension(nlam) :: ulam
            real*8 :: thr
            integer optional :: isd=1 ! Standardize predictors by default

アップデート

_glmnetこのモジュールはどこにありますか? 以下に示すように、glmnet.pyf ファイルに含まれていますか? この glment フォルダーを に追加しようとしましPYTHONPATHたが、何も変わりませんでした。

~/221/tagger/tagger/glmnet master ls
__init__.py                  example_lasso_elastic_net.py glmnet.pyc
__init__.pyc                 glmnet.f                     glmnet.pyf
elastic_net.py               glmnet.py
~/221/tagger/tagger/glmnet master head -10 glmnet.pyf
!    -*- f90 -*-
! Note: the context of this file is case sensitive.

python module _glmnet ! in
    interface  ! in :_glmnet
        subroutine elnet(ka,parm,no,ni,x,y,w,jd,vp,ne,nx,nlam,flmin,ulam,thr,isd,lmu,a0,ca,ia,nin,rsq,alm,nlp,jerr) ! in :glmnet:glmnet.f
            integer optional :: ka=1 ! Use covariance updates over naive by default
            real*8 :: parm
            integer intent(hide),check(shape(x,0)==no),depend(x) :: no=shape(x,0)
            integer intent(hide),check(shape(x,1)==ni),depend(x) :: ni=shape(x,1)
~/221/tagger/tagger/glmnet master echo $PYTHONPATH
/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet:
~/221/tagger/tagger/glmnet master cd ..
~/221/tagger/tagger master python main.py
Traceback (most recent call last):
  File "main.py", line 14, in <module>
    from glmnet import glmnet
  File "/Users/rose/221/tagger/tagger/glmnet/glmnet.py", line 2, in <module>
    import _glmnet
ImportError: No module named _glmnet
4

2 に答える 2

2

ソースからわかる限りで_gmlnetは、 で定義されているモジュールを探していますgmlnet.pyfgmlnet.pyfは python モジュールではなく、 というプログラムの追加命令のセットでありf2py、python はファイルを無視し.pyfます。.pyfを使用して、fortran ファイルとともにファイルをコンパイルする必要がありますf2py。次のようなコマンドを使用します。

f2py -c --fcompiler=gnu95 gmlnet.pyf gmlnet.f

パッケージf2pyをインストールしてから再インストールしてみてください。gmlnet

于 2013-12-10T23:49:30.443 に答える