/boot/grub/menu.lst の Linux のエントリに次の行を追加して、myScriptを実行できませんか。
title Ubuntu 9.04, kernel 2.6.28-11-generic
uuid b20f1720-b3f5-4162-bc92-ab2deb8d5d04
#kernel /boot/vmlinuz-2.6.28-11-generic root=UUID=b20f1720-b3f5-4162-kernel/boot/vmlinuz-2.6.28-11-generic root=UUID=b20f1720-b3f5-4162-bc92-ab2deb8d5d04 ro
initrd /boot/initrd.img-2.6.28-11-generic
/home/baltoros/Desktop/myScript
この時点で myScript を実行することさえ可能ですか?