BorderPaneファイルのルートペインとして使用していFXMLます。ただし、コンパイラはプロパティBorderPaneがないと文句を言いcontrollerます! FXMLコントローラ クラスをルートがにバインドする方法はBorderPane?
<BorderPane id="rootPane" xmlns="http://javafx.com/javafx/8" xmlns:fx="http://javafx.com/fxml/1" fx:controller="com.saei.explorer.FXMLDocumentController">
BorderPaneウィンドウのサイズ変更時にレイアウトを引き伸ばす機能があるため、使用しています。