次のように、パッケージのmetaMDS
関数を使用して 1 次元の再スケーリングを行っています。vegan
mydata <- data.frame(X = sample(1:50), Y = sample(1:50), Z = sample(1:50))
mds <- metaMDS(mydata, distance="euclidian", autotransform=FALSE, k=1)
(この例にはランダムなデータが含まれているだけで、収束しない可能性がありますが、ここでのポイントは視覚化であるため、問題ではありません。)
これをプロットする(plot(mds))
と、元のデータ ポイントとデータの次元を含む適切な縦軸が得られます。ただし、軸が水平になるようにプロットを回転させたいと思いますが、ラベルは垂直方向に読みやすいようにします。
metaMDS からの 1 次元の MDS 結果を水平方向の図としてプロットするにはどうすればよいですか?