SPen と Note 3 を使用しています。
SPen SDK で SCanvasView の背景を透明に設定できました。
しかし、今は SpenSurfaceView を使用する Samsung Mobile SDK を使用しています。
目標は、サーフェス ビューを他のビューの上に重ねることです。
mSCanvas = new SCanvasView(this);
...
mSCanvas.setSCanvasInitializeListener(new SCanvasInitializeListener() {
@Override
public void onInitialized() {
...
mSCanvas.setBGColor(Color.TRANSPARENT);
}