database - 情報獲得を使用して遺伝子をランク付けする方法は?

Question

情報利得とカイ二乗統計を使用して、マイクロアレイデータの遺伝子ランキングをどのように行うのですか?? 簡単な例で説明してください..

Answer 1

オープンソースの機械学習ソフトウェアWekaを使用できます。データセットをロードし、[属性の選択]タブに移動します。次の属性エバリュエーターを使用します。

ChiSquaredAttributeEval：クラスに関するカイ2乗統計の値を計算することにより、属性の価値を評価します。

InfoGainAttributeEval：クラスに関する情報ゲインを測定することにより、属性の価値を評価します。

.. 「検索方法」でランカーを使用する。このようにして、属性は個々の評価によってランク付けされます

Answer 2

私はあなたの質問を正確に理解していませんが、マイクロアレイデータを分析するための非常に成功したパッケージはここにあります：

BioConductor

これは、マイクロアレイからデータを読み取り、統計分析を実行するためのさまざまなモジュールを備えたソフトウェアプロジェクトです。マイクロアレイデータのファイル形式は技術の進歩とともに絶えず変化しており、マイクロアレイデータを分析するためのアルゴリズムも大幅に進歩しているため、これは非常に便利です。