JDK 7 では、jaxb2-maven-plugin は apt が削除されているという警告を生成しますが、現在は JDK8 に含まれており、プラグインを JDK8 で動作させる方法がわかりません。
警告: apt ツールとそれに関連する API は、次の主要な JDK リリースで削除される予定です。これらの機能は、javac と標準化された注釈処理 API、javax.annotation.processing および javax.lang.model に取って代わられました。javac の注釈処理機能に移行することをお勧めします。詳細については、javac のマニュアル ページを参照してください。
プロジェクトページMJAXB-83でチケットを作成しました。