Rでは、最適化問題に目的関数と制約のみを指定すると、ヤコビ/ヘッセ/スパースパターンを分析的に見つけることができますか?
AMPL はこれを行い、MATLAB でもこれを行うことができると聞いていますが、これに Knitro が必要かどうかはわかりません。
ただし、R のすべての最適化ツール (nloptr など) では、勾配と Hessian を自分で入力する必要があるようです。複雑なモデルを扱っているため、これは非常に困難です。
Rでは、最適化問題に目的関数と制約のみを指定すると、ヤコビ/ヘッセ/スパースパターンを分析的に見つけることができますか?
AMPL はこれを行い、MATLAB でもこれを行うことができると聞いていますが、これに Knitro が必要かどうかはわかりません。
ただし、R のすべての最適化ツール (nloptr など) では、勾配と Hessian を自分で入力する必要があるようです。複雑なモデルを扱っているため、これは非常に困難です。
あなたが探しているものは、自動微分と呼ばれます。残念ながら、R では利用できないようです。
5 年前にそれを実装する試みがありましたが、私の簡単な調査では、これらの試みがなくなったことを示しています。
かなり最近の R パッケージ ( Automatic Differentiation Model Builder ) がありますが、それをどのように使用するか、またはこれを状況に適用する方法が不明です。(私自身は R を使用していないため、わかりません。)
私はmadnessと呼ばれる R の自動微分の基本パッケージを作成しました。主に多変量デルタ法用に設計されていますが、勾配の自動計算にも使用できるはずです。使用例:
require(madness)
# the 'fit' is the Frobenius norm of Y - L*R
# with a penalty for strongly negative R.
compute_fit <- function(R,L,Y) {
Rmad <- madness(R)
Err <- Y - L %*% Rmad
penalty <- sum(exp(-0.1 * Rmad))
fit <- norm(Err,'f') + penalty
}
set.seed(1234)
R <- array(runif(5*20),dim=c(5,20))
L <- array(runif(1000*5),dim=c(1000,5))
Y <- array(runif(1000*20),dim=c(1000,20))
ftv <- compute_fit(R,L,Y)
show(ftv)
show(val(ftv))
show(dvdx(ftv))
私は以下を返します:
class: madness
d (norm((numeric - (numeric %*% R)), 'f') + (sum(exp((numeric * R)), na.rm=FALSE) + numeric))
calc: ------------------------------------------------------------------------------------------------
d R
val: 207.6 ...
dvdx: 4.214 4.293 4.493 4.422 4.672 2.899 2.222 2.565 2.854 2.718 4.499 4.055 4.161 4.473 4.069 2.467 1.918 2.008 1.874 1.942 0.2713 0.2199 0.135 0.03017 0.1877 5.442 4.81
1 5.472 5.251 4.674 1.933 1.62 1.79 1.902 1.665 5.232 4.435 4.789 5.183 5.084 3.602 3.477 3.419 3.592 3.376 4.109 3.937 4.017 3.816 4.2 1.776 1.784 2.17 1.975 1.699 4.365 4
.09 4.475 3.964 4.506 1.745 1.042 1.349 1.084 1.237 3.1 2.575 2.887 2.524 2.902 2.055 2.441 1.959 2.467 1.985 2.494 2.223 2.124 2.275 2.546 3.497 2.961 2.897 3.111 2.9 4.44
2 3.752 3.939 3.694 4.326 0.9582 1.4 0.8971 0.8756 0.9019 2.399 2.084 2.005 2.154 2.491 ...
varx: ...
[,1]
[1,] 207.6
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[1,] 4.214 4.293 4.493 4.422 4.672 2.899 2.222 2.565 2.854 2.718 4.499 4.055 4.161 4.473 4.069 2.467 1.918 2.008 1.874 1.942 0.2713 0.2199 0.135 0.03017 0.1877 5.442 4.811
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[1,] 5.472 5.251 4.674 1.933 1.62 1.79 1.902 1.665 5.232 4.435 4.789 5.183 5.084 3.602 3.477 3.419 3.592 3.376 4.109 3.937 4.017 3.816 4.2 1.776 1.784 2.17 1.975
[,55] [,56] [,57] [,58] [,59] [,60] [,61] [,62] [,63] [,64] [,65] [,66] [,67] [,68] [,69] [,70] [,71] [,72] [,73] [,74] [,75] [,76] [,77] [,78] [,79] [,80] [,81]
[1,] 1.699 4.365 4.09 4.475 3.964 4.506 1.745 1.042 1.349 1.084 1.237 3.1 2.575 2.887 2.524 2.902 2.055 2.441 1.959 2.467 1.985 2.494 2.223 2.124 2.275 2.546 3.497
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[1,] 2.961 2.897 3.111 2.9 4.442 3.752 3.939 3.694 4.326 0.9582 1.4 0.8971 0.8756 0.9019 2.399 2.084 2.005 2.154 2.491
導関数は 5 x 20 行列に関するスカラーの導関数ですが、ここではベクトルに平坦化されていることに注意してください。(残念ながら行ベクトルです。)
1)のデフォルトの Nelder Mead メソッドはoptim
導関数を必要とせず、内部的にも計算しません。
2) D
、deriv
および関連する R 関数 ( を参照?deriv
) は、単純なシンボリック導関数を計算できます。
3) Ryacasパッケージは、シンボリック導関数を計算できます。
solnp
、パッケージを見てくださいRsolnp
。これは、解析的なヤコビアンまたはヘッシアンを必要としない非線形計画法ソルバーです。
min f(x)
s.t. g(x) = 0
l[h] <= h(x) <= u[h]
l[x] <= x <= u[x]