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LOC_NAME,BIRTH_DTTM,MOM_PAT_MRN_ID,EMPI,MOM_PAT_NAME,MOM_HOSP_ADMSN_TIME,MOM_HOSP_DISCH_TIME,DEL_PROV_NAME,ATTND_PROV_NAME,DELIVERY_TYPE,PRIM.REPT,COUNT_OF_BABIES,CHILD_PED_GEST_AGE_NUM,REASON_FOR_DEL,REASON_DEL_COM,INDUCT_METHOD,INDUCT_COM,AUGMENTATION
HOSPITAL,1/1/2000 10:00,abc,Eabc,"Surname1, Given1",1/1/2000 10:00,1/3/2000 10:00,"Doctor, First","Doctor, First","C-Section, Low Transverse",Repeat,1,38,,,1) None,,1) None
HOSPITAL,1/2/2000 11:00,def,Edef,"Surname2, Given2",1/2/2000 11:00,1/5/2000 11:00,"Doctor2, First2","Doctor2, First2","C-Section, Low Transverse",Primary,1,36,Ruptured Membranes;Labor;Other (see comment),"PPROM, Preterm labor",1) None,,1) None
HOSPITAL,1/3/2000 12:00,ghi,Eghi,"Surname3, Given3",1/3/2000 12:00,1/6/2000 12:00,"Doctor3, First3","Doctor3, First3","C-Section, Low Transverse",Repeat,1,31,Other (see comment),,1) None,,1) None
HOSPITAL,1/4/2000 13:00,jkl,Ejkl,"Surname4, Given4",1/4/2000 13:00,1/7/2000 13:00,,"Doctor4, First4","Vaginal, Spontaneous Delivery",,1,28,Other (see comment),Fetal anomaly,1) oxytocin (Pitocin),,
データを読み込むために、私は試しました：
read.csv.sql(file)
read.csv.sql(file, filter = 'tr.exe -d ^" ')
read.csv.sql(file, filter = list('gawk -f prog', prog = '{ gsub(/"/, ""); print }'))
read.csv.sql(file,
filter = "perl -e 's{(\"[^\",]+),([^\"]+\")}{$_= $&, s/,/_/g, $_}eg'")
私は R 3.0.0 で R Studio Server を Ubuntu OS で使用しています。
残念ながら、区切り文字を変更することはオプションではありません (クエリを実行する必要がある一部のファイルにはあまり効果的ではありません。私のファイルの一部は病理レポートであるため、どの区切り文字を使用しても、この問題。
これを読むために何が欠けているかについてのヒントはありますか?