パッケージrollapply
から使用して行うことができます:zoo
library(zoo)
cat = c("A", "A", "A", "A", "B", "B", "B", "B")
year = c(1990, 1991, 1992, 1993, 1990, 1991, 1992, 1993)
value = c(2, 3, 5, 6, 8, 9, 4, 5)
df = data.frame(cat, year, value)
df$stdev <- unlist(by(df, df$cat, function(x) {
c(NA, rollapply(x$value, width=2, sd))
}), use.names=FALSE)
print(df)
## cat year value stdev
## 1 A 1990 2 NA
## 2 A 1991 3 0.7071068
## 3 A 1992 5 1.4142136
## 4 A 1993 6 0.7071068
## 5 B 1990 8 NA
## 6 B 1991 9 0.7071068
## 7 B 1992 4 3.5355339
## 8 B 1993 5 0.7071068
よりも関数をddply
使用したい場合は、次のようにすることもできます。plyr
by
df$stdev <- ddply(df, .(cat), summarise,
stdev=c(NA, rollapply(value, width=2, sd)))$stdev
ヒバリとして、上記の2つの方法と、この回答の下のコメントスレッドで@thelatemailによって指摘された方法system.time
を(複数回)比較しました(データフレームの「新しい」コピーから始めます)。ave
df <- data.frame(cat, year, value)
system.time(df$stdev <- with(df, ave(value, cat, FUN=function(x) c(NA, rollapply(x, width=2, sd)))))
df <- data.frame(cat, year, value)
system.time(df$stdev <- unlist(by(df, df$cat, function(x) c(NA, rollapply(x$value, width=2, sd))), use.names=FALSE))
df <- data.frame(cat, year, value)
system.time(df$stdev <- ddply(df, .(cat), summarise, stdev=c(NA, rollapply(value, width=2, sd)))$stdev)
ave
メソッドとメソッドはどちらも次の値をby
取ります。
user system elapsed
0.002 0.000 0.002
ddply
バージョンは次のとおりです。
user system elapsed
0.004 0.000 0.004
ここで実際に速度が問題になるわけではありませんが、ave
とby
バージョンがこれを行う最も効率的な方法のようです。