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グラフにデータポイント (円) をプロットしたい場合は、それと x/y 座標を指定する必要があります。Y 軸には数字がありますが、X 軸にはカスタム名ラベルを付けるようにフォーマットしました。これらのカスタム ラベルは、それぞれ 100、200、300 などの tickValue を持つ 100 ピクセルの距離で配置されます。

        xAxis = d3.svg.axis()
            .scale(xScale)
            .orient("bottom")
            .tickValues(createTickValuesArray(arr.length))
            .tickFormat(formatAxis);

createTickValuesArray は、数値の配列を生成するだけです。

データポイントをプロットしたい場合、数値を与える必要がありますか? または、どうにかして x 軸のラベル名を使用できますか?

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