私は運が悪かったグーグルを試しました。Pythonで実行されたが、コードではない堅牢なマルチ配列平均化への弱参照をいくつか見ました。私は車輪の再発明にはあまり興味がありません。Pythonモジュール、スクリプトに関する提案...。
アルゴリズムの良い説明や例を見つけることができれば、共有するPython実装を作成します。
私が何について話しているのかわからない場合は、これは定義ではありませんが、これを見ることができます。 http://www.mathworks.com/access/helpdesk/help/toolbox/bioinfo/ref/gcrma.html
この質問は6年以上前に行われたものですが、最近同じ質問をしたときでも、RMAの適切なPython実装を見つけることができませんでした。したがって、私は方法論について多くの調査を行い、自分で1つ書きました。
また、技術的な詳細を説明する記事を書きました。
pyAffy：Affymetrix式マイクロアレイからの生データを処理するためのRMAメソッドの効率的なPython/Cython実装
gcrmaパッケージを含むR用のPythonインターフェースの使用を検討することをお勧めします。RPyは、システムにインストールされているすべてのRモジュールを使用できるようにするモジュールです。BioconductorにはR用のgcrmaモジュールがあります。これを行うPython用のモジュールは見つかりませんでした。
私はゲノミクスで働いている生物学者であり、5〜6個のマイクロアレイプロジェクトに貢献しました。私はPythonにもかなり精通しており、Rでもかなりうまくいくことができます。
Pythonは素晴らしい言語ですが、今のところ、あなたの要求に簡単に合うモジュールがないことを私は知っています。一方、Rは、マイクロアレイ分析用の幅広いパッケージを提供します。
マイクロアレイデータ分析が標準的なマイクロアレイチップ/テクノロジーの医学的使用によってどのように推進されるかを考えると、生物学研究は分析目的でカスタム開発された（主にR）パッケージを使用する必要がありました。残念ながら、この状況は、研究生の群衆にそれほど評価されていない、より本格的なプログラミング言語でのマイクロアレイデータ分析にそれほど興味深いニッチを残していないと私は信じています。
Pythonの代替案を見つけていただければ幸いです。その場合は、お知らせください。
乾杯