Scikit DBSCAN を探索しようとしています。知りたいことがあります。すべてのクラスターのポイントを知るにはどうすればよいですか。
このコードは、scipy Web サイトの例です。
import numpy as np
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn import metrics
from sklearn.datasets.samples_generator import make_blobs
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
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# Generate sample data
centers = [[1, 1], [-1, -1], [1, -1]]
X, labels_true = make_blobs(n_samples=750, centers=centers, cluster_std=0.4,
random_state=0)
X = StandardScaler().fit_transform(X)
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# Compute DBSCAN
db = DBSCAN(eps=0.3, min_samples=10).fit(X)
core_samples = db.core_sample_indices_
labels = db.labels_
# Number of clusters in labels, ignoring noise if present.
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
print("Homogeneity: %0.3f" % metrics.homogeneity_score(labels_true, labels))
print("Completeness: %0.3f" % metrics.completeness_score(labels_true, labels))
print("V-measure: %0.3f" % metrics.v_measure_score(labels_true, labels))
print("Adjusted Rand Index: %0.3f"
% metrics.adjusted_rand_score(labels_true, labels))
print("Adjusted Mutual Information: %0.3f"
% metrics.adjusted_mutual_info_score(labels_true, labels))
print("Silhouette Coefficient: %0.3f"
% metrics.silhouette_score(X, labels))
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#Modification I am doing
print labels
print labels[0]
unique_labels = set(labels)
for k in unique_labels:
class_members = [index[0] for index in np.argwhere(labels == k)]
#cluster_core_samples = [index for index in core_samples if labels[index] == k]
print class_members[0]
for index in class_members:
x = X[index]
print x
リバース エンジニアリングのアルゴリズムを見つける必要があるようです
StandardScaler().fit_transform(X)
DBSCAN の scipy 実装は、DBSCAN Code - DBSCAN Test Unitに示されています。
すべてのクラスターに属する 3 つのクラスターとポイントを出力したいと思います。
アップデート
inverse_transform() 関数を実行しようとすると、次の行でエラーが発生します
ファイル「/Users/macbook/anaconda/lib/python2.7/site-packages/sklearn/preprocessing/data.py」、384行目、inverse_transform
ここでコードを見つけることができます: https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/blob/master/sklearn/preprocessing/data.py
if self.with_std:
X *= self.std_
if self.with_mean:
X += self.mean_
ここでエラーが発生しました。この問題を解決するためのアイデアはありますか?