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Smacof パッケージの smacofSym 関数について質問があります。RStudio バージョン 0.98.501 から R バージョン 3.1.0 を使用しています。

次のコマンドを使用しています。

MDSdata <- smacofSym(DJaccardMatrix, ndim=2, metric=FALSE, verbose=TRUE).

私が使用しているデータ (DJaccardMatrix) の詳細を以下に示します。smacofSym を実行するたびに、最終的な構成が互いに重なっている構成になります。結果のサンプルを次に示します。

MDSdata$conf
         D1          D2
1    0.06259624 -0.01494732
2    0.06276541 -0.01480409
3    0.06266933 -0.01492375
4    0.06262438 -0.01496111
5    0.06243336 -0.01496193
6    0.06258047 -0.01502270
7    0.06247747 -0.01500037 .......

結果を確認するために、XLStat で同じマトリックスを実行したところ、期待どおりの結果が得られました。これは、より分散されたポイントのセットです。他のヘルプ リクエストをいくつか見てから、smacofSym を行列と分散の両方として実行してみましたが、どちらも結果には影響しませんでした。

マトリックスとしてのDJaccardMatrixに関する私の情報は次のとおりです。

num [1:121, 1:121] 0 0.969 0.679 0.704 0.939 ...
attr(*, "dimnames")=List of 2 
..$ : chr [1:121] "1" "2" "3" "4" ...
..$ : chr [1:121] "1" "2" "3" "4" ...

distオブジェクトとしてのDJaccardMatrixに関する私の情報は次のとおりです。

Class 'dist'  atomic [1:7260] 0.969 0.679 0.704 0.939 0.8 ...
  ..- attr(*, "Size")= int 121
  ..- attr(*, "call")= language as.dist.default(m = dissmat)
  ..- attr(*, "Diag")= logi FALSE
  ..- attr(*, "Upper")= logi FALSE

人々の推薦に感謝します。私はそれが非常に基本的なものであると仮定していますが、私は間違いなくそれを見つけていません. (ちなみに、これは解釈に関するものなので無視してかまいません。smacof が報告する非計量的ストレスと Kruskal のストレスとの関係は何ですか?何かありますか?)

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