r - Rでは、別のオブジェクトのクラスに基づいてS4クラスを設定するにはどうすればよいですか

Question

Bioconductor の ShortRead ライブラリから ShortReadQ タイプのオブジェクトを作成する必要があります。

ShortReadQ 'signature(sread = "DNAStringSet", quality =
          "QualityScore", id = "BStringSet")'

品質スロットは、エミュレートしたい別の ShortReadQ オブジェクトから簡単に判断できる QualityScore から継承するオブジェクトである必要があります。

> class(quality(anotherObject))
[1] "SFastqQuality"
attr(,"package")
[1] "ShortRead"

コンストラクター引数でその情報 (「SFastqQuality」) を使用する最良の方法は何ですか?

newObject<-ShortReadQ(sread=...,
             quality=SFastqQuality(...), 
             id=...)

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これはあなたが望むことをしますか？

quality = new(class(old.quality.obj)[[1]]))

于 2010-03-02T04:25:11.210 に答える

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get関数が必要な場合があります。

a <- get(class(object))
a(...)

于 2010-03-02T04:50:00.743 に答える

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ご回答ありがとうございます。彼らは私をうまくいく解決策に導きます

newObject<-ShortReadQ(sread=...,
             quality=new(Class=class(quality(anotherObject)),theFirstParameter=...), 
             id=...)

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