http://pj.freefaculty.org/blog/?p=140の最後の (3 番目の) アプローチで R スクリプトのプロファイルを作成しようとしています。私がしていること(以下で説明)は正しいのだろうか?
まず、my.cppでは、リンクに を追加するよう#include <gperftools/profiler.h>に記載されていますが、これは機能しません。ヘッダーが別のディレクトリにあることがわかりました。私にとっては#include <google/profiler.h>.
次に、プロファイリングするコードの周りに次のコードを配置します
ProfilerStart("./myprofile.log")
//the part of the code to be profiled
ProfilerStop()
次に、以下を含むスクリプト mytest.R を作成しました。
Sys.setenv("PKG_LIBS"="-lprofiler")
sourceCpp('my.cpp') # for compiling the cpp file
... (use some functions defined in my.cpp
最後に、bash で実行すると
$ R -f mytest.R
Rセッションを実行し、Rmytest.R内のコンテンツを実行し、出力後にRを終了します
PROFILE: interrupts/evictions/bytes = 353/0/1988
プロファイリングが正常に実行されたことを意味しますか? 「中断」と「立ち退き」は私には面倒に見えます。
へのプロファイリング出力を生成しますmyprofile.log。
$ google-pprof --text /usr/bin/R myprofile.log
私は見えます
Total: 353 samples
37 10.5% 10.5% 37 10.5% b313b2cb
21 5.9% 16.4% 21 5.9% b313b2b8
18 5.1% 21.5% 18 5.1% b313b2ce
15 4.2% 25.8% 15 4.2% _IO_str_pbackfail
10 2.8% 28.6% 10 2.8% b69be532
9 2.5% 31.2% 9 2.5% b69be520
7 2.0% 33.1% 7 2.0% b69bd111
6 1.7% 34.8% 6 1.7% b313b2dc
6 1.7% 36.5% 6 1.7% b69bd132
5 1.4% 38.0% 5 1.4% b69bb50f
5 1.4% 39.4% 5 1.4% b69bb6d8
4 1.1% 40.5% 4 1.1% b3133bda
4 1.1% 41.6% 4 1.1% b3134c2b
4 1.1% 42.8% 4 1.1% b313b298
4 1.1% 43.9% 4 1.1% b69bd159
3 0.8% 44.8% 3 0.8% b3134c32
3 0.8% 45.6% 3 0.8% b313b29b
3 0.8% 46.5% 3 0.8% b313b2c8
3 0.8% 47.3% 3 0.8% b69bb6e0
3 0.8% 48.2% 3 0.8% b69bb6f1
3 0.8% 49.0% 3 0.8% b69bcef1
3 0.8% 49.9% 3 0.8% b69bd100
最後の列のエントリは人間が読めるものではありません。
私は何かを見逃しているのだろうか?ありがとう!