cluster-analysis - ELKI DBSCAN クラスタリングの結果を表示する方法

Question

約 14,000 個の GPS ポイントの DBSCAN クラスタリングに ELKI を使用しています。正常に動作していますが、クラスター内のポイント数などのクラスターに関する情報を確認したいです。

Answer 1

-resulthandler ResultWriter を使用してテキストに出力する場合、クラスター サイズは各クラスター ファイルの先頭になります。

また、これらすべての結果を 1 つのファイルにマージする場合は、次の python スクリプトが機能します。

clusterout_path = "path/to/where/files/all/go/"
finalout_path = "/path/for/single/merged/file/"
consol_filename= "single_merged_file.txt"

cll_file = open(finalout_path + consol_filename,"a")
cll_file.write("ClusterID"+ "\t" + "Lon" + "\t" + "Lat" + "\n")
def readFile(file):
    f = open(clusterout_path + file)
    counter = 0
    cluster = ""
    lon = ""
    lat = ""
    for line in f.readlines():
        counter+=1
        if counter == 1:
            cluster = line.split(":")[1].strip().lower()

        if counter > 4 and line.startswith("ID"):
            arr = line.split(" ")
            lon = arr[1]
            lat = arr[2]
            cll_file.write(cluster + "\t" + lon + "\t" + lat + "\n") 
    f.close()

listing = os.listdir(clusterout_path)
for infile in listing:
    print "Processing file: " + infile
    readFile(infile) 

cll_file.close()