文字列全体のすべての位置で 4 文字の頻度をカウントしたいと考えています。文字はA、T、G、Cです
TGAGGTAGTAGTTTGTGCTGTTAT
TAGTAGTTTGTGCTGTTA
TGAGGTAGTAGTTTGTAC
TGAGAACTGAATTCCATAGG
望ましい出力:
Pos1 Pos2 Pos3 and so on.
A 0 1
T 4 0
C 0 0
G 0 3
これまでのところ、私は Biostrings と呼ばれる R パッケージを使用してきましたが、これは動作しますが、perl でこれができるのだろうか?