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非常に基本的な質問がありますが、解決できません。同じディレクトリに複数のファイルがあり、ファイルの各ペアを連結したいと考えています。名前は次のとおりです。

Sample1_R1_L001.fastq Sample1_R2_L001.fastq Sample2_R1_L001.fastq Sample2_R2_L001.fastq Sample3_R1_L001.fastq Sample3_R2_L001.fastq

(等...)

私が望む結果は、 cat Sample1_R1_L001.fastq Sample1_R2_L001.fastq > Sample1_concat.fastq のように、サンプルごとに連結することです

このループ、 find を試しました。-name " _R?_ "|ファイルの読み取り中; do "$file" R1 *.fastq "$file"_R2_L001.fastq > "$file"_merged.fastq

しかし、うまくいきませんでした。何かご意見は?

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