r - ggplot2 を使用した PCA 射影プロット

Question

最大の分散を持つ軸へのポイントの投影のアイデアを示すプロットがあります。のコードをR以下に貼り付けます。このプロットを で再現する方法の最初のポインタが必要ggplot2です。

# Simulate data
library(mvtnorm)
set.seed(2014)
Sigma <- matrix(data = c(4, 2, 2, 3), ncol=2)
mu <- c(1, 2)
n <- 20
X <- rmvnorm(n = n, mean = mu, sigma = Sigma)

# Run PCA
pca <- princomp(X)
load <- loadings(pca)
slope <- load[2, ] / load[1, ]
cmeans <- apply(X, 2, mean)
intercept <- cmeans[2] - (slope * cmeans[1])

# Plot data & 1st principal component
plot(X, pch = 20, asp = 1)
abline(intercept[1], slope[1])

# Plot perpendicular segments
x1 <- (X[, 2] - intercept[1]) / slope[1]
y1 <- intercept[1] + slope[1] * X[, 1]
x2 <- (x1 + X[, 1]) / 2
y2 <- (y1 + X[, 2]) / 2
segments(X[, 1], X[, 2], x2, y2, col = "red")