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RスクリプトをEclipseに実行したい。

  • R 3.1.1
  • Ubuntu 12.04
  • エクリプス・ケプラー

  • 瓶:

    • JRI.jar
    • REngine.jar
    • RserveEngine.jar

  • 環境 (実行 -> 実行構成 -> 環境)

    • R_HOME : /usr/local/lib/R

コード：

import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.FileNotFoundException;
import java.io.FileReader;
import java.io.IOException;
import org.rosuda.REngine.REXP;
import org.rosuda.REngine.REXPMismatchException;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RConnection;
import org.rosuda.REngine.Rserve.RserveException;
import org.rosuda.JRI.Rengine;

public class HelloWorldApp {

    public static void main(String[] args) throws RserveException, REXPMismatchException, FileNotFoundException, IOException {
        RConnection c = new RConnection("localhost",6311);
        if(c.isConnected()) {
            System.out.println("Connected to RServe.");
            if(c.needLogin()) {
                System.out.println("Providing Login");
                c.login("username", "password");
            }

            REXP x = c.eval("1:10");
            for(int i=0;i < x.length();i++)
            {
                System.out.println(x.asIntegers()[i]);
            }
            System.out.println("Reading script...");
            Rengine r = new Rengine(args, true, null);

            r.eval(" plot (x");            

        } else {
            System.out.println("Rserve could not connect");
        }

        c.close();
        System.out.println("Session Closed");
    }

}

出力：

Connected to RServe.

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Reading script...

Fatal error: you must specify '--save', '--no-save' or '--vanilla'

Rstudio で同じエラーが発生しました:

library("Rserve")
Rserve()

出力：

Starting Rserve:
/usr/local/lib/R/bin/R CMD /home/mansi/R/x86_64-unknown-linux-gnu-library/3.1/Rserve/libs//Rserve 
Fatal error: you must specify '--save', '--no-save' or '--vanilla'

この致命的なエラーを解決するのを手伝ってください。

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2 に答える 2

9 
Try: Rserve(args='--vanilla')

私は同じ問題を抱えていましたが、これは私にとってはうまくいきました。

于 2014-12-03T22:42:42.603 に答える
2

RServe の代わりに、rJava パッケージに同梱されている JRI を使用できます。

私の意見では、JRI は RServe よりも優れています。別のプロセスを作成する代わりに、ネイティブ呼び出しを使用して Java と R を統合するからです。

JRI を使用すると、ポート、接続、ウォッチドッグなどについて心配する必要はありません。R への呼び出しは、オペレーティング システム ライブラリ (libjri) を使用して行われます。

メソッドは RServe とよく似ており、REXP オブジェクトを引き続き使用できます。

例があります：

public void testMeanFunction() {

    // just making sure we have the right version of everything
    if (!Rengine.versionCheck()) {
        System.err.println("** Version mismatch - Java files don't match library version.");
        fail(String.format("Invalid versions. Rengine must have the same version of native library. Rengine version: %d. RNI library version: %d", Rengine.getVersion(), Rengine.rniGetVersion()));
    }

    // Enables debug traces
    Rengine.DEBUG = 1;

    System.out.println("Creating Rengine (with arguments)");
    // 1) we pass the arguments from the command line
    // 2) we won't use the main loop at first, we'll start it later
    // (that's the "false" as second argument)
    // 3) no callback class will be used
    engine = REngine.engineForClass("org.rosuda.REngine.JRI.JRIEngine", new String[] { "--no-save" }, null, false);
    System.out.println("Rengine created...");

    engine.parseAndEval("rVector=c(1,2,3,4,5)");
    REXP result = engine.parseAndEval("meanVal=mean(rVector)");
    // generic vectors are RVector to accomodate names
    assertThat(result.asDouble()).isEqualTo(3.0);
}

REST API を公開し、このパッケージを使用して R 関数を呼び出すデモ プロジェクトがあります。

見てみましょう: https://github.com/jfcorugedo/RJavaServer

于 2015-09-08T17:04:55.070 に答える