eHOF パッケージの HOF 機能で、ネストされた研究デザインを検討したいと思います。サンプルブロックにネストされたポイントと、村にネストされたポイント(ランダム)でサンプリングしました。
これまでのところ、種の豊富さ (SpR、応答変数、固定) に対する生息地の種類 (生息地、説明、固定) の影響を説明するために GLMM を使用しました。したがって、ネストされた研究デザインを関数に組み込むことができる lme (nlme-package) を使用しました。
model1<-lme(SpR~Habitat,random=~1|Village/Block,data=birds) # full model
ここで、勾配に沿った SpR への影響について説明したいと思います。私の HOF 関数は次のようになります。
hof.blocks<-HOF(SpR,Indexc,M=max(SpR),bootstrap=100,
family=poisson)
入れ子になった研究デザインを HOF に組み込む方法はありますか?
また、P 値も F 値または R2 値も取得できませんでした。私は何かを見落としましたか?
パッケージ: eHOF バージョン: 1.4 R バージョン 3.0.2