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eHOF パッケージの HOF 機能で、ネストされた研究デザインを検討したいと思います。サンプルブロックにネストされたポイントと、村にネストされたポイント(ランダム)でサンプリングしました。

これまでのところ、種の豊富さ (SpR、応答変数、固定) に対する生息地の種類 (生息地、説明、固定) の影響を説明するために GLMM を使用しました。したがって、ネストされた研究デザインを関数に組み込むことができる lme (nlme-package) を使用しました。

model1<-lme(SpR~Habitat,random=~1|Village/Block,data=birds) # full model

ここで、勾配に沿った SpR への影響について説明したいと思います。私の HOF 関数は次のようになります。

hof.blocks<-HOF(SpR,Indexc,M=max(SpR),bootstrap=100,
                 family=poisson)

入れ子になった研究デザインを HOF に組み込む方法はありますか?

また、P 値も F 値または R2 値も取得できませんでした。私は何かを見落としましたか?

パッケージ: eHOF バージョン: 1.4 R バージョン 3.0.2

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いいえ、現時点ではありません。を使用して手動で非線形モデルを適合させることができますnlme()。おそらく、式などを指定する方法に関するヒントについてeHOFnlme()パッケージ コードを調べますが、そのパッケージは非線形オプティマイザーを直接使用するため、そうする必要はありません。nlme他の詳細を使用して解決できるモデル式を取得するための翻訳作業。

于 2014-09-10T19:57:27.987 に答える