私はチュートリアル（またはここに示されているテストコードに従っています。私のツリーは、ドキュメントに示されている方法とは完全に異なって見えます。私のツリーには、ノードラベル、距離スコアなどの情報がありません。私は Phylo を見ましたwikiですが、不完全なようです. ノードにそれぞれの名前 (phyloxml ファイルから) とブランチの長さを付けたいと思います. 以下に私の phyloxml ファイルのリンクを投稿しています. どんな助けも大歓迎です. .
PhyloXML ファイル : http://pastie.org/9661690
これは私のグラフが今どのように見えるかです:
コード：
import pylab
from Bio import Phylo
tree = Phylo.read('allseqs.dnd', 'newick')
tree.rooted=True
Phylo.draw_graphviz(tree, ,prog = 'neato', node_size =500)
pylab.show()