以下を使用できます。
<fileset dir="C:\Program Files\eclipse\plugins\myplugin">
<include name="extraStuff.jar" />
</fileset>
しかし、Eclipse をデフォルトのフォルダーにインストールしなかった他のユーザーの PC では、ビルド ファイルが壊れてしまいます。
私の場合、ハードフォルダー参照なしではbasedirを使用できません。
Eclipse で実行されている ant から使用できる Eclipse インストール フォルダーへの「ショートカット」はありますか?