lsmeans 関数を使用して、データの時間依存性を調査しています。
lme=lme(attraction~factor(time),random=~1|id, data=na.exclude(subject))
lme.lms=lsmeans(lme, "time")
summary(lme.lms)
time lsmean SE df asymp.LCL asymp.UCL
1 0.5823399 0.01805961 NA 0.5469394 0.6177403
2 0.5662435 0.01805961 NA 0.5308430 0.6016439
3 0.5225464 0.01805961 NA 0.4871459 0.5579468
4 0.4938745 0.01805961 NA 0.4584740 0.5292750
5 0.4884408 0.01805961 NA 0.4530403 0.5238412
6 0.5079754 0.01805961 NA 0.4725749 0.5433758
7 0.4521263 0.01805961 NA 0.4167258 0.4875268
8 0.4604106 0.01808727 NA 0.4249559 0.4958653
![plot(lme.lms)][1]
このプロットの X 軸と Y 軸を転置して、lsmean が Y 軸になり、時間が X 軸になるようにする必要があります。最初に lsmean 推定値と SE 出力を独自のオブジェクトとして保存する方法を見つけないと、これを行う方法がわかりません。しかし、私はこれを行う方法を理解できません。
lme.lms$lsmean
他の関数については、やのようなことができるかもしれませんがlme.lms$SE
、これを試すと、次のエラーが発生します。
Error in subject.lme2.lms$lsmean : $ operator not defined for this S4 class
オンラインで調べたところ、lsmeans の出力はクラス "lsmobj" であることがわかりましたが、そのクラスを操作する方法がわかりません。