公開された記事の要約をすべて簡単にダウンロードする方法を知っている人はいますか? 私はテキストマイニングプロジェクトに取り組んでいます。
私が見つけることができる最も近いものは、pmid を指定して一度に 1 つの要約をダウンロードできますが、一度に 1 つずつダウンロードする必要があるため、私の目的には遅すぎます。
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FTP 経由で直接 NLM からすべてのデータを取得できます。
https://www.nlm.nih.gov/databases/download/terms_and_conditions_pubmed.html
e-utils を気にせずにダウンロードして作業してください。
于 2015-11-23T00:15:27.650 に答える
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を検索すると"0000/01/01"[PDAT] : "3000/12/31"[PDAT]、最初からすべての記事が表示されます。
おそらく、検索結果のすぐ上に表示される「送信先」機能を使用すると、すべてをダウンロードできます。
または、スクリプトを作成し、NCBI から Entrez プログラミング ユーティリティを使用することもできます。
ESearch を使用して検索クエリを実行すると、すべての PMID が返されます。次に、EFetch を使用してすべてのデータを返すことができます。この本/マニュアルで説明されています: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25501/
第 3 章には、開始するためのいくつかのサンプル スクリプトが含まれています 。
抄録とその他すべてのデータを含む xml ファイルを取得します。
2,500 万の XML ファイル...
于 2015-03-28T20:57:33.497 に答える
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Europe PMC が提供する RESTful APIを使用します。クエリごとに 25 個の記事を json または xml 形式でダウンロードできます。マラリアに関する記事のクエリの例は次のようになります。
- http://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/search/query=malaria&resulttype=core&page=1
- http://www.ebi.ac.uk/europepmc/webservices/rest/search/query=malaria&resulttype=core&page=2
さまざまな形式の検索クエリを使用できますが、実際に何を取得したいかによって異なります。
于 2015-03-12T12:29:54.600 に答える
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これが少し古くなったことは承知していますが、まったく同じユースケース（大規模なマイニングプロジェクト）のプロセスがあります。
データは、無料のライセンス契約を通じて取得できます。詳細については、こちらを参照してください。
于 2015-07-24T19:36:52.803 に答える