パッケージs(... bs = "fs")
内で構築された因子平滑相互作用のプロットを作成しました。mgcv
ただし、xlim
とのmain
引数 (および他のいくつかの引数) はplot.gam()
適切に機能していないように見えますが、他の種類のスムーズをプロットするための同じ引数が機能します。
これが例です。
更新: 私が抱えている問題をよりよく反映するように例を修正しました (2014 年 12 月 2 日)。
library(mgcv)
# create toy data
set.seed(1)
d <- data.frame(
x = runif(10 * 100),
f = rep(paste0("f", 1:10), each = 100)
)
d$y <- 2 * d$x + 10 + rnorm(10 * 100)
# build a model
model <- gam(y ~ s(x) + s(x, f, bs = "fs"), data = d)
上記の用語に対応するプロットを生成する次のコードは、s(x)
意図したとおりに x 軸を制限し、タイトルを配置します。
plot(model, select = 1, xlim = c(0.4, 0.6), main = "Title")
ただし、上記の用語に対応するプロットを生成する次のコードはs(x, f, bs = "fs")
、x 軸を制限したり、タイトルを生成したりしません。
plot(model, select = 2, xlim = c(0.4, 0.6), main = "Title")
mgcv::plot.gam()
引数 (の一部) をmgcv:::plot.fs.interaction()
または場合によっては渡すことができないと思われますmgcv:::plot.mgcv.smooth()
が、それが発生する理由と修正方法を理解できていません。助けていただければ幸いです。