私は MVAPICH2 の新しいユーザーであり、使い始めたときにトラブルに遭遇しました。
まず、次の方法で正常にインストールできたと思います:
./configure --disable-fortran --enable-cuda
make -j 4
make install
エラーはありませんでした。
しかし、example のディレクトリで cpi の例を実行しようとすると、次のように遭遇しました。
パスワードなしで ssh 経由でノード gpu-cluster-1 と gpu-cluster-4 を接続できました。
mpirun_rsh を使用して gpu-cluster-1 と gpu-cluster-4 で cpi の例を別々に実行したところ、次のように問題なく動作しました:
run@gpu-cluster-1:~/mvapich2-2.1rc1/examples$ mpirun_rsh -ssh -np 2 gpu-cluster-1 gpu-cluster-1 ./cpi
プロセス 0/2 は gpu-cluster-1 上にあります プロセス 1/2 は gpu-cluster-1
上にあります
pi は約 3.1415926544231318、エラーは 0.0000000008333387
壁時計時間 = 0.000089
run@gpu-cluster-4:~/mvapich2-2.1rc1/examples$ mpirun_rsh -ssh -np 2 gpu-cluster-4 gpu-cluster-4 ./cpi
プロセス 0/2 は gpu-cluster-4 上にあります
プロセス 1 gpu-cluster-4 上に 2 個あります
pi は約 3.1415926544231318、エラーは 0.0000000008333387
ウォール クロック時間 = 0.000134 ですmpiexec を使用して gpu-cluster-1 と gpu-cluster-4 の両方で cpi の例を実行したところ、次のように問題なく動作しました:
run@gpu-cluster-1:~/mvapich2-2.1rc1/examples$ mpiexec -np 2 -f hostfile ./cpi プロセス
0/2 は gpu-cluster-1 にあります プロセス1/2
は gpu-cluster-4 に ありcluster-1\ngpu-cluster-4"しかし、gpu-cluster-1 と gpu-cluster-4 で mpirun_rsh、borh を使用して cpi の例を実行すると、問題が発生しました:
run@gpu-cluster-1:~/mvapich2-2.1rc1/examples$ mpirun_rsh -ssh - np 2 -hostfile hostfile ./cpi プロセス 1/2 は gpu-cluster-4 にあります
-----------------ここで動かなくなり、進行しません ------- -----------------
久しぶりに Ctrl + C を押すと、
^C[gpu-cluster-1:mpirun_rsh][signal_processor] Caught signal 2 が表示されます。 , kill job
run@gpu-cluster-1:~/mvapich2-2.1rc1/examples$ [gpu-cluster-4:mpispawn_1][read_size] ファイル記述子の予期しない End-Of-File 6. MPI プロセスが停止しましたか?
[gpu-cluster-4:mpispawn_1][read_size] ファイル記述子 6 で予期しない End-Of-File が発生しました。MPI プロセスが停止しましたか?
[gpu-cluster-4:mpispawn_1][handle_mt_peer] PMI ソケットの読み取り中にエラーが発生しました。MPI プロセスが停止しましたか?
[gpu-cluster-4:mpispawn_1][report_error] connect() が失敗しました: 接続が拒否されました (111)
長い間混乱していました。この問題を解決するために何か助けてもらえますか?
cpi の例のコードは次のとおりです。
#include "mpi.h"
#include <stdio.h>
#include <math.h>
double f(double);
double f(double a)
{
return (4.0 / (1.0 + a*a));
}
int main(int argc,char *argv[])
{
int n, myid, numprocs, i;
double PI25DT = 3.141592653589793238462643;
double mypi, pi, h, sum, x;
double startwtime = 0.0, endwtime;
int namelen;
char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
MPI_Init(&argc,&argv);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&numprocs);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myid);
MPI_Get_processor_name(processor_name,&namelen);
fprintf(stdout,"Process %d of %d is on %s\n",
myid, numprocs, processor_name);
fflush(stdout);
n = 10000; /* default # of rectangles */
if (myid == 0)
startwtime = MPI_Wtime();
MPI_Bcast(&n, 1, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD);
h = 1.0 / (double) n;
sum = 0.0;
/* A slightly better approach starts from large i and works back */
for (i = myid + 1; i <= n; i += numprocs)
{
x = h * ((double)i - 0.5);
sum += f(x);
}
mypi = h * sum;
MPI_Reduce(&mypi, &pi, 1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD);
if (myid == 0) {
endwtime = MPI_Wtime();
printf("pi is approximately %.16f, Error is %.16f\n",
pi, fabs(pi - PI25DT));
printf("wall clock time = %f\n", endwtime-startwtime);
fflush(stdout);
}
MPI_Finalize();
return 0;
}