いくつかの環境データ (climond) を使用して、35 ラスターで PCA を実行していました。すべて正常に動作し、R でこのコマンドを使用して、ラスター スタックで PCA を実行します。
pca<-princomp(na.omit(values(s)), cor=TRUE)
すべてのラスターは問題ないように見えますが、各コンポーネントはまったく同じ比率の分散 (0.029) を説明しているため、最終的に合計すると 1 になります。最初の 3 つの pca などの結果に慣れているので、私にとっては少し奇妙です。軸は分散の 50% を説明し、残りのコンポーネントは分散の説明をますます少なくしています。私の結果は正しいですか、それともprinccompを変更する必要がありますか? それは次のようになります。
Comp.1 Comp.2 Comp.3 Comp.4 Comp.5 Comp.6 Comp.7 Comp.8 Comp.9
SS loadings 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000
Proportion Var 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029
Cumulative Var 0.029 0.057 0.086 0.114 0.143 0.171 0.200 0.229 0.257
Comp.10 Comp.11 Comp.12 Comp.13 Comp.14 Comp.15 Comp.16 Comp.17
SS loadings 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000
Proportion Var 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029
Cumulative Var 0.286 0.314 0.343 0.371 0.400 0.429 0.457 0.486
Comp.18 Comp.19 Comp.20 Comp.21 Comp.22 Comp.23 Comp.24 Comp.25
SS loadings 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000
Proportion Var 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029
Cumulative Var 0.514 0.543 0.571 0.600 0.629 0.657 0.686 0.714
Comp.26 Comp.27 Comp.28 Comp.29 Comp.30 Comp.31 Comp.32 Comp.33
SS loadings 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000
Proportion Var 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029 0.029
Cumulative Var 0.743 0.771 0.800 0.829 0.857 0.886 0.914 0.943
Comp.34 Comp.35
SS loadings 1.000 1.000
Proportion Var 0.029 0.029
Cumulative Var 0.971 1.000
ただし、固有値 (またはここでは標準偏差) は減少しています。
Comp.1 Comp.2 Comp.3 Comp.4 Comp.5 Comp.6
4.129756e+00 2.608465e+00 1.679122e+00 1.514034e+00 1.380337e+00 1.196104e+00
Comp.7 Comp.8 Comp.9 Comp.10 Comp.11 Comp.12
8.529524e-01 7.653760e-01 5.784449e-01 5.179734e-01 4.731845e-01 3.555741e-01
Comp.13 Comp.14 Comp.15 Comp.16 Comp.17 Comp.18
2.995183e-01 2.672110e-01 2.287449e-01 1.907395e-01 1.776953e-01 1.665386e-01
Comp.19 Comp.20 Comp.21 Comp.22 Comp.23 Comp.24
1.547910e-01 1.389805e-01 1.216129e-01 1.167798e-01 1.106441e-01 8.282240e-02
Comp.25 Comp.26 Comp.27 Comp.28 Comp.29 Comp.30
7.930042e-02 7.283533e-02 6.605863e-02 6.310874e-02 4.944323e-02 4.318459e-02
Comp.31 Comp.32 Comp.33 Comp.34 Comp.35
3.272761e-02 2.591280e-02 2.395581e-02 1.479677e-02 1.191348e-07
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