python - cholmod ライブラリに接続しようとしている Python Swig の NameError

Question

SuiteSparseライブラリ ( SuiteSparse )の一部であるC Cholmodライブラリへの Python インターフェイスを作成しようとしています。

私は Swig を初めて使用するので、これが困難な作業であるかどうかはわかりません。Swig で行われたこのインターフェースへの参照は見つかりませんでした。

コンパイルは問題なく行われます。

これは、swig で生成された「_cholmod.py」ファイルをインポートしようとすると発生するエラーです。

Python 2.7.5+ (default, Feb 27 2014, 19:37:08)
[GCC 4.8.1] on linux2
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>> import _cholmod
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "_cholmod.py", line 99, in <module>
    class SuiteSparse_config_struct(_object):
  File "_cholmod.py", line 106, in SuiteSparse_config_struct
    __swig_setmethods__["malloc_func"] =
__cholmod.SuiteSparse_config_struct_malloc_func_set
NameError: name '_SuiteSparse_config_struct__cholmod' is not defined

この名前はどこで定義されていますか? 拡張機能をインポートしようとする前に、簡単な grep では何も返されません が、インポートしようとすると次のようになります。

grep -R -n  _SuiteSparse_config_struct__cholmod *

Binary file _cholmod.pyc matches

私は使用しています：

• SWIG バージョン 3.0.5 g++ でコンパイル [x86_64-unknown-linux-gnu] 設定オプション: +pcre
• SuiteSparse 4.4.3 の cholmod ライブラリ

最小限の例を次に示します。

ファイル setup.py:

from distutils.core import setup, Extension

module1 = Extension('__cholmod',
    sources=['cholmod.i'],
    libraries=['cholmod', 'suitesparseconfig', 'blas', 'amd'],
    library_dirs=['/home/nikolaj/Documents/WORK/Dominique/suitesparse
4.4.1-1_ArchLinux/suitesparse-4.4.1-1-x86_64.pkg/usr/lib/'],
    include_dirs=['/home/nikolaj/Documents/WORK/Dominique/suitesparse
4.4.1-1_ArchLinux/suitesparse-4.4.1-1-x86_64.pkg/usr/include/'],
    swig_opts=['-I/home/nikolaj/Documents/WORK/Dominique/suitesparse
4.4.1-1_ArchLinux/suitesparse-4.4.1-1-x86_64.pkg/usr/include/'])

setup(name='_cholmod', version='0.1', ext_modules=[module1])

そして、私はそれを次のように呼び出します:

python setup.py build_ext --inplace

ファイル cholmod.i:

/* -*- C -*- */
#ifdef SWIGPYTHON

%module _cholmod

%{
#define SWIG_FILE_WITH_INIT
#include "SuiteSparse_config.h"

#include "cholmod_config.h"
#include "cholmod_core.h"
#include "numpy/arrayobject.h"
%}

%feature("autodoc", "1");

%init %{
    import_array();
%}

%include "SuiteSparse_config.h
%include "cholmod_config.h"
%include "cholmod_core.h"

#endif

typedef と C 構造体に問題があると思いますが、チュートリアル、公式ドキュメント、プレゼンテーションを何度も読んだ後、何が欠けているのか本当にわかりません。

ここで誰か助けてくれませんか？どうもありがとう！