Gstat パッケージを使用して、R でユニバーサル cokriging を実行しようとしています。私は助けられたスクリプトを持っていますが、今は立ち往生していて、元のソースに助けを求めることができません。問題は、cokriged データの出力解像度を変更できないことです。補間されたマップを ArcMap にインポートしたいのですが、ポイントからラスターへの変換で解像度が非常に低くなります。
私のスクリプトは次のとおりです。
library(raster)
library(gstat)
library(sp)
library(rgdal)
library(FitAR)
座標とサンプル値を含むデータセットを読み込みます:
kova<-read.table("katvus_point_modif3.txt",sep=" ",header=T)
coordinates(kova)=~POINT_X+POINT_Y
前と同じ座標で深度値をロードすると、これは私の共変量です:
Sygavus<-read.table("sygavus_point_cokrig.txt",sep=" ",header=T)
coordinates(Sygavus)=~POINT_X+POINT_Y
overlay <- over(kova,Sygavus)
kova$Sygavus <- overlay$Sygavus
これは、補間の境界を設定することになっています。ファイルは、ArcMap からエクスポートされたシェープファイルです。
border <- shapefile("area_2014.shp")
projection(kova)=projection(border)
これは cokriging 用のグリッドを作成することになっており、res= を使用して出力を希望する解像度を指定できるはずですが、どの数値を使用しても出力は変わりません。
grid <- spsample(border,type="regular",res=25)
重なっているポイントを削除します。
zero <- zerodist(kova)
kova <- kova[-zero[,2],]
深度共変量ラスター ファイルを読み込みます。これは、ArcMap から ASCII 形式への深度ラスター エクスポートです。
depth <- raster("htp_depth_covar.asc")
projection(depth)=projection(border)
overlay <- extract(depth,kova)
kova$depth <- overlay
な!オーバーレイ深度値からの値 (これらの値は、それぞれの座標で以前に読み込まれた深度共変量テーブルと同じである必要がありますが、その部分を除外すると、スクリプトは機能しなくなります)
kova <- kova[!is.na(kova$depth),]
kova.gstat <- gstat(id="Kova",formula=kova~depth,data=kova)
kova.gstat <- gstat(kova.gstat,id="Sygavus",formula=Sygavus~depth,data=kova)
var.kova <- variogram(kova.gstat)
plot(var.kova)
kova.gstat <- gstat(kova.gstat,id=c("Kova","Sygavus"),model=vgm(psill=cov(kova$kova,kova$Sygavus),model="Mat",range=12000,nugget=0))
kova.gstat <- fit.lmc(var.kova,kova.gstat,model=vgm(psill=cov(kova$kova,kova$Sygavus),model="Mat",range=12000,nugget=0))
plot(var.kova,kova.gstat$model)
overlay <- extract(depth,grid)
grid <- as.data.frame(grid)
grid$depth <- overlay
coordinates(grid)=~x1+x2
projection(grid)=projection(border)
krige <- predict.gstat(kova.gstat,grid)
spplot(krige,c("Kova.pred"))
write.table(krige, "kova.raster1.ck.csv", sep=";", dec=",", row.names=F)
gstat cokriging とスクリプト全体を理解するための助けをいただければ幸いです。