を使用して for ループを介して多数のプロットを作成し、ggplot
各プロットをリストに保存しましたplots
。
plots <- list()
for (i in 1:238)
{
gene <- row.names(geneExpression)[i]
df.sub <- df[ , c("source", gene)]
names(test.sub) <- c("source", "exp")
plots[[i]] <- ggplot() + geom_violin(data=test.sub, aes(source, exp, fill=source, color=source), alpha=.4, trim=F, environment = environment()) + coord_flip() + ggtitle(gene) + theme(legend.position="none") + labs(x="")
}
他の場所で提案されているように gridExtra 関数を使用していますが、これを行うと、すべてのプロット (240 プロット) が 1 ページに印刷されます。
pdf("violinPlots.pdf")
do.call(grid.arrange, plots)
dev.off()
ページごとに 24 個のプロットを指定する方法はありますか? (つまり、6 行 x 4 列?)
これを試しましたが、エラーが返されます...
grid.arrange(plots, ncol=4, newpage = T )