0

ランプを使って銅ナノ粒子の応力・ひずみ曲線を描いてみたいと思います。これは私のコードです。これが正しいかどうかはわかりません。誰でも私を助けることができますか?fix nveリラックスするためにあるが、その前にある、fix nvtそしてこの2つのfixesは一緒に来ることはできません。

# tensile   test
echo both
dimension  3  
boundary   s  p   p
units  metal  
atom_style  atomic

##########create  box#######
region  copperbox   block  -80  80   -40   40   -40  40  units box
create_box  1  copperbox
lattice  fcc  3.61
region  copper  block  -60  60  -20  20  -20  20  units box 
create_atoms  1  region  copper  
mass  1  63.546 
thermo_modify lost ignore  
region      left  block   -60  -50  -20  20   -20   20    units box
group       left region left
region      right  block 50  60   -20   20   -20   20    units box
group       right region right
group   middle   subtract   all   left   right 
timestep   0.002

pair_style   eam  
pair_coeff  * *  cu_u3.eam
velocity  all  create  300  4928459  mom  yes  rot  yes   dist  uniform  
velocity  left  create   0   4928459   mom  yes  rot  yes   dist   uniform   
velocity  right  create   0   4928459   mom  yes  rot  yes   dist   uniform
fix  1  all  nvt  temp  300  300  0.01  
fix  2  left   setforce   0  0  0
fix  3  right  setforce   0   0   0
fix  4   all  nve  
thermo 100
run  1000
#####################################

compute  1  middle stress/atom
compute  2  middle  reduce   sum   c_1[1]
dump        1 all custom 100 stress.txt mass x y z c_1[1]  c_1[2]  c_1[3]  
c_1[4] c_1[5] c_1[6]
dump        2 all xyz 100 dump.xyz

#####################################

variable a loop 2
label loopa
fix  8   right  move  linear   0.2   0  0  units  box
fix  9   left   move   linear   0   0  0   units  box
run 1000

#####################################

unfix   8 
unfix  9
fix  8   right  move   linear  0  0  0  units box
fix  9   left   move  linear    0  0  0  units box
run 40000

#####################################
fix  10   all  nve  
thermo 100
run 10000

#####################################

variable   sigma  equal  "c_2/(40000)*(10^4)"
variable   l2  equal  xcm(right,x)

variable  l0   equal  ${l2}
variable   strain  equal  "(v_l2-v_l0)/(v_l0)*100"
next a
jump in.copper99 loopa
restart         1000 restart.*
4

0 に答える 0