python - networkxグラフをjsonグラフに保存する方法は?

Question

json グラフ形式をエクスポートする方法が networkx にあるはずですが、表示されません。これは nx.to_dict_of_dicts() で簡単にできるはずですが、少し操作が必要になると思います。シンプルでエレガントなソリューションを知っている人はいますか?

Answer 1

このドキュメントには完全な説明が含まれています

簡単な例は次のとおりです。

import networkx as nx
from networkx.readwrite import json_graph

DG = nx.DiGraph()
DG.add_edge('a', 'b')
print json_graph.dumps(DG)

グラフの視覚化に物理演算を追加するJavascript/SVG/D3の素敵な例もご覧ください。

Answer 2

これは、結果を読み戻すコードとともに、私が行ったばかりの JSON アプローチです。必要な場合に備えて、ノードとエッジの属性を保存します。

import simplejson as json
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
# add nodes, edges, etc to G ...

def save(G, fname):
    json.dump(dict(nodes=[[n, G.node[n]] for n in G.nodes()],
                   edges=[[u, v, G.edge[u][v]] for u,v in G.edges()]),
              open(fname, 'w'), indent=2)

def load(fname):
    G = nx.DiGraph()
    d = json.load(open(fname))
    G.add_nodes_from(d['nodes'])
    G.add_edges_from(d['edges'])
    return G

Answer 3

ノードとエッジは十分な情報ですか？もしそうなら、あなたはあなた自身の関数を書くことができます：

json.dumps(dict(nodes=graph.nodes(), edges=graph.edges()))