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Fortran モジュールを使用する R ライブラリを作成しました。Linuxではすべてが魅力のように機能します。

今、私はそれをWindowsで動作させようとしています。Windows コンピューターでgit リポジトリのクローンbuild and reloadを作成しました。Rstudio でボタンを押すと、次のエラーが表示されます。

==> Rcmd.exe INSTALL --no-multiarch --with-keep.source MyPi

* installing to library 'C:/Users/IMartinez/Documents/R/R-3.2.1/library'
* installing *source* package 'MyPi' ...
** libs
gfortran -m64 -shared -s -static-libgcc -o MyPi.dll tmp.def Fpi.o -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib/x64 -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib -LC:/Users/IMARTI~1/DOCUME~1/R/R-32~1.1/bin/x64 -lR
Fpi.o: In function `__fortranpi_MOD_dboard':
Fpi.f90:(.text+0xd7): undefined reference to `__stack_chk_fail'
Fpi.o: In function `pi_':
Fpi.f90:(.text+0x249): undefined reference to `__stack_chk_fail'
collect2: ld returned 1 exit status
no DLL was created
ERROR: compilation failed for package 'MyPi'
* removing 'C:/Users/IMartinez/Documents/R/R-3.2.1/library/MyPi'

Exited with status 1.

私は何が欠けていますか?


Module Fortranpi
IMPLICIT NONE
contains
subroutine dboard(darts, dartsscore)
  integer, intent(in)                    :: darts
  double precision, intent(out)          :: dartsscore
  double precision                       :: x_coord, y_coord
  integer                                :: score, n

score = 0
do n = 1, darts
  call random_number(x_coord)
  call random_number(y_coord)

  if ((x_coord**2 + y_coord**2) <= 1.0d0) then
  score = score + 1
  end if
end do

dartsscore = 4.0d0*score/darts

end subroutine dboard

subroutine pi(avepi, DARTS, ROUNDS) bind(C, name="pi_")
  use, intrinsic                         :: iso_c_binding, only : c_double, c_int
  real(c_double), intent(out)            ::  avepi
  integer(c_int), intent(in)             ::  DARTS, ROUNDS
  integer                                ::  MASTER, rank, i, n
  integer, allocatable                   ::  seed(:)
  double precision                       ::  pi_est, homepi, pirecv, pisum

! we set it to zero in the sequential run
rank = 0
! initialize the random number generator
! we make sure the seed is different for each task
call random_seed()
call random_seed(size = n)
allocate(seed(n))
seed = 12 + rank*11
call random_seed(put=seed(1:n))
deallocate(seed)

avepi = 0
do i = 0, ROUNDS-1
  call dboard(darts, pi_est)
  ! calculate the average value of pi over all iterations
  avepi = ((avepi*i) + pi_est)/(i + 1)
end do
end subroutine pi

end module Fortranpi

この投稿で推奨されているように、追加しまし-fno-stack-protector -lsspたが、役に立ちませんでした。追加する場所を間違えたのではないでしょうか?

Rスタジオ


私も手作業でやってみましたが、これらのエラーが発生しました:

> system("R CMD SHLIB -fno-stack-protector -lssp ./src/Fpi.f90")
gfortran -m64 -shared -s -static-libgcc -o src/Fpi.dll tmp.def ./src/Fpi.o -fno-stack-protector -lssp -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib/x64 -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib -LC:/Users/IMARTI~1/DOCUME~1/R/R-32~1.1/bin/x64 -lR
> dyn.load("./src/Fpi.dll")
Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) : 
  unable to load shared object 'C:/Users/IMartinez/Projects/MyPi/./src/Fpi.dll':
  LoadLibrary failure:  %1 is not a valid Win32 application. 'C:/Users/IMartinez/Projects/MyPi/./src/Fpi.dll':
  LoadLibrary failure:  %1 is not a valid Win32 application.

ここに画像の説明を入力


@cdeterman の指示に従って、次のことを行いました。

  1. 次の行で作成Makevars.winしましたsrc

    PKG_FCFLAGS="-fno-stack-protector"

  2. 次に、NAMESPACE の useDynLin(Fpi) を useDynLib(MyPi) に変更しました。

これは私が得るものです:

==> Rcmd.exe INSTALL --no-multiarch --with-keep.source MyPi

* installing to library 'C:/Users/IMartinez/Documents/R/R-3.2.1/library'
* installing *source* package 'MyPi' ...
** libs
gfortran -m64 -shared -s -static-libgcc -o MyPi.dll tmp.def Fpi.o -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib/x64 -Ld:/RCompile/r-compiling/local/local320/lib -LC:/Users/IMARTI~1/DOCUME~1/R/R-32~1.1/bin/x64 -lR
Fpi.o: In function `__fortranpi_MOD_dboard':
Fpi.f90:(.text+0xd7): undefined reference to `__stack_chk_fail'
Fpi.o: In function `pi_':
Fpi.f90:(.text+0x249): undefined reference to `__stack_chk_fail'
collect2: ld returned 1 exit status
installing to C:/Users/IMartinez/Documents/R/R-3.2.1/library/MyPi/libs/x64
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
Error in library.dynam(lib, package, package.lib) : 
  DLL 'MyPi' not found: maybe not installed for this architecture?
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing 'C:/Users/IMartinez/Documents/R/R-3.2.1/library/MyPi'
* restoring previous 'C:/Users/IMartinez/Documents/R/R-3.2.1/library/MyPi'

Exited with status 1.
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1 に答える 1

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Makevars.win次の行を使用して、ディレクトリにファイルを作成しますsrc

PKG_FCFLAGS="-fno-stack-protector"

次に、パッケージ名と同じようuseDynLib(Fpi)に NAMESPACE も変更します。useDynLib(MyPi)

パッケージをビルドしてみてください。使用されているフラグが出力に表示されない場合は、環境変数が現在存在せず、機能していない可能性があります。なぜこれが起こるのか正確にはわかりません。この場合は、単に環境変数を初期化してください。

Sys.setenv(PKG_FCFLAGS = "")

これにより、パッケージが Windows システムでビルドされます。

于 2015-07-27T19:18:53.427 に答える