細菌代謝モデルの比較に取り組んでいます。各モデルには、200 時点の代謝物とその濃度のセットがあります。モデルを比較して、類似性に基づいてクラスター化する作業を行っています。私が従った 1 つの方法は、ユークリッド距離を使用して 2 つのモデルの代謝産物のペアのそれぞれについてペアごとの比較を行うことです。以下は、私のデータがどのように見えるかです。これはサンプル データ ファイルです。
モデル A の Met1 とモデル B の Met1 のペアごとのユークリッド距離を計算しました。同様に、2 つのモデル間のすべての共通代謝産物 (モデル A の Met4 とモデル B の Met4) の距離を計算し、距離を合計して距離を取得しました。 (相違点) 2 つのモデルの間。同様に、すべてのモデルの非類似度マトリックスを計算し、階層的クラスタリングを使用してそれらをクラスター化しました。
ここで、離散ウェーブレット変換を距離測定として使用して、モデルの非類似度を計算したいと考えています。ただし、パッケージ定義には、2 つの時系列を比較する方法が見つかりませんでした。Discrete Wavelet Transformation を使用して 2 つの時系列間の非類似距離を計算する方法、つまり私のモデルの方法を知りたいです。