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R と rmongodb を使用して、MongoDB NoSQL データベースからデータを抽出しています。try()悪いデータから発生する問題をキャッチするロジックを入れました。ほとんどの場合try()、エラーをキャッチして、不正なデータ オブジェクトをスキップします。ただし、時々、それをキャッチするのに「失敗」し、プログラムが停止します。以下は、時々機能するが、たまに失敗するコードですif(inherits(...))。関数iter1を呼び出す前に、(私が知っている限り)有効であることを確認するためにチェックを入れました。mongo.son.iterator.value()実際、try()プログラム全体で以下のような呼び出しで使用しました。前に試しtryCatchたことがありますが、結果は同じだったと思います。どんな助けでも大歓迎です!

v2 <- try(mongo.bson.iterator.value(iter1)) 

if(inherits(v2, "try-error")) {
    cat("mongo.bson.iterator.VALUE(iter1) ERROR ^^^^^^ , next!")
    Sys.sleep(10)
    next;
}

出力:

ItemName =  VH013269
before value(iter1)
 type of iter1:  integer
 *** caught segfault ***
address 0x7402cd5, cause 'memory not mapped'
Traceback:
 1: .Call(".mongo.bson.iterator.value", iter)
 2: mongo.bson.iterator.value(iter1)
 3: doTryCatch(return(expr), name, parentenv, handler)
 4: tryCatchOne(expr, names, parentenv, handlers[[1L]])
 5: tryCatchList(expr, classes, parentenv, handlers)
 6: tryCatch(expr, error = function (e) {
        call <- conditionCall(e)
        if (!is.null(call)) {
            if (identical(call[[1L]], quote(doTryCatch))) 
                call <- sys.call(-4L)
            dcall <- deparse(call)[1L]
            prefix <- paste("Error in", dcall, ": ")
            LONG <- 75L
            msg <- conditionMessage(e)
            sm <- strsplit(msg, "\n")[[1L]]
            w <- 14L + nchar(dcall, type = "w") + nchar(sm[1L], type = "w")
            if (is.na(w)) 
                w <- 14L + nchar(dcall, type = "b") + nchar(sm[1L], type = "b")
            if (w > LONG) 
                prefix <- paste0(prefix, "\n  ")
        }
        else prefix <- "Error : "
        msg <- paste0(prefix, conditionMessage(e), "\n")
        .Internal(seterrmessage(msg[1L]))
        if (!silent && identical(getOption("show.error.messages"), 
            TRUE)) {
            cat(msg, file = stderr())
            .Internal(printDeferredWarnings())
        }
        invisible(structure(msg, class = "try-error", condition = e))
    })
 7: try(mongo.bson.iterator.value(iter1))
 8: eval(expr, envir, enclos)
 9: eval(ei, envir)
10: withVisible(eval(ei, envir))
11: source("parcc_mci_v5.R")
Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace
Selection:
4

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1

tryR レベルでのみエラーをキャッチできます。表示される segfault は、.mongo.bson.iterator.valueC/C++ 関数がアクセスすべきではないメモリにアクセスしているためです。

可能であれば、再現可能な例とともに、これをパッケージ管理者に報告する必要があります。

于 2015-08-05T19:06:52.193 に答える