CHOLMOD
でCUDA
アクセラレーションを使用しようとしていますSuiteSparse 4.4.4
。ユーザーガイドに従ってコンパイルしたところ、フォルダーgpu.sh
の下でDemo
正常に実行できました。これは、GPU が作業の一部を行っていることを示していました。しかし、 を使用して独自のコードを実行しようとするとCHOLMOD
、GPU 呼び出しの数が常に 0 であることがわかりましたCommon->useGPU
。1 に設定し、環境変数CHOLMOD_USE_GPU
も 1 に設定します。私の Makefile は次のようなものです。ライブラリ パスが正しい。私への提案はありますか?
実際には、線形システムを解くための最も単純なテスト ケースを実行しているだけであることに言及する必要がありました。
UF Sparse Matrix Collection からいくつかのマトリックスを試しましたが、アプリケーションがプロファイルされnvprof
ていないことが示されました。CUDA
私が試したいくつかの行列:
bmw7st_1: http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/matrices/GHS_psdef/bmw7st_1.html
nd6k: http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/matrices/ND/nd6k.html
nd24k: http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/matrices/ND/nd24k.html
コード:
#include <stdio.h>
#include <time.h>
#include <unistd.h>
#include <assert.h>
#include <sys/time.h>
#include "cholmod.h"
int main (void)
{
struct timeval t1, t2;
double elapsedTime;
const char* matFile = "../bmw7st_1.mtx";
FILE* fp = fopen(matFile, "r");
assert(fp != NULL);
cholmod_sparse *A ;
cholmod_dense *x, *b;
cholmod_factor *L ;
cholmod_common* c = (cholmod_common*)malloc(sizeof(cholmod_common));
cholmod_start (c) ; /* start CHOLMOD */
c->useGPU = 1;
c->supernodal = CHOLMOD_SUPERNODAL;
A = cholmod_read_sparse (fp, c) ; /* read in a matrix */
cholmod_print_sparse (A, "A", c) ; /* print the matrix */
fclose(fp);
if (A == NULL || A->stype == 0) /* A must be symmetric */
{
cholmod_free_sparse (&A, c) ;
cholmod_finish (c) ;
return (0) ;
}
b = cholmod_ones (A->nrow, 1, A->xtype, c) ; /* b = ones(n,1) */
gettimeofday(&t1, NULL);
L = cholmod_analyze (A, c) ; /* analyze */
cholmod_factorize (A, L, c) ; /* factorize */
x = cholmod_solve (CHOLMOD_A, L, b, c) ; /* solve Ax=b */
gettimeofday(&t2, NULL);
elapsedTime = (t2.tv_sec - t1.tv_sec) * 1000.0;
elapsedTime += (t2.tv_usec - t1.tv_usec) / 1000.0;
printf("Time: %.4f ms\n", elapsedTime);
cholmod_free_factor (&L, c) ; /* free matrices */
cholmod_free_sparse (&A, c) ;
cholmod_free_dense (&x, c) ;
cholmod_free_dense (&b, c) ;
cholmod_finish (c) ; /* finish CHOLMOD */
return (0) ;
}
メイクファイル:
CC = gcc
CFLAGS = -g -Wall -O2 \
-lrt -lgfortran \
-gdwarf-2
LIBS = $(CHOLMOD)/Lib/libcholmod.a \
$(AMD)/Lib/libamd.a \
$(COLAMD)/Lib/libcolamd.a \
$(LAPACK)/liblapack.a \
$(OPENBLAS)/lib/libopenblas.so \
$(XERBLA)/libcerbla.a \
$(METIS)/libmetis.a \
$(CAMD)/Lib/libcamd.a \
$(CCOLAMD)/Lib/libccolamd.a \
$(SUITESPARSE)/SuiteSparse_config/libsuitesparseconfig.a \
$(CUDART_LIB) \
$(CUBLAS_LIB)
HEADER_DIR = $(CHOLMOD)/Include
CONFIG_HEADER_DIR = $(SUITESPARSE)/SuiteSparse_config
OBJ_DIR = .
BIN_DIR = .
INCLUDES = -I$(HEADER_DIR) \
-I$(CONFIG_HEADER_DIR)
SRCS = $(shell ls *.c)
OBJS = $(SRCS:.c=.o)
OBJS_BUILD = $(shell ls $(OBJ_DIR)/*.o)
APP = prog
RM = rm -f
all: $(APP)
$(APP): $(OBJS)
$(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN_DIR)/$(APP) $(OBJS_BUILD) $(LIBS)
%.o: %.c $(HEADER_DIR)/*.h $(CONFIG_HEADER_DIR)/*.h
$(CC) $(CFLAGS) $(INCLUDES) -c $< -o $(OBJ_DIR)/$@
clean:
$(RM) $(OBJS_BUILD) $(APP)