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端末 (OSX) から LAMMPS パッケージを呼び出そうとしています。

ここのドキュメントは、Mac OSX では「正常に動作する」ことを示しているようで、ここでは次のコマンドを使用してライブラリに接続しています。

$ lmp_linux

この最小限のドキュメントを介して自作でスクリプトをインストールし、インストールが正しいことを確認しました。これは、自作のインストールに精通している人がすぐに答えられるかもしれないものだと思います

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