JWrapper を約 1 年間使用していますが、問題はありません。
現在、Mac OS X El Capitan を搭載したあるユーザーのマシンでは、ほとんどの場合、ソフトウェアの新しいバージョンをリリースするたびに、最初の起動時に JWrapper スプラッシュ スクリーンがシステムを再起動するまで消えることはありません。
ログを確認しましたが、疑わしいものは何もありません。アプリケーションが正しく起動しているようです。
提案を歓迎します。これは私が知っている適切な SO の質問ではありませんが、JWrapper の人々は、SO での無料バージョンのサポートを実験していると言っているので、基本的にはこれに答えてもらいたいと思っています。