sbatch を使用してジョブを送信しています。
コマンドラインは次のmpirun --versionようになります:
Linux* OS 用インテル(R) MPI ライブラリー、バージョン 5.0 ビルド 20140507
Copyright (C) 2003-2014, Intel Corporation. 全著作権所有。
だから私はIntel mpiで作業していると思います。指示に従って: Intel MPI を使用して MPI ジョブを送信し、
次のようにスクリプトを記述します。
#!/bin/bash
#SBATCH --ntask=4
#SBATCH -t 00:10:00
. ~/.bash_profile
module load intel
mpirun mycc
mycc は、mpicc でソース ファイルをコンパイルした後に取得する実行可能ファイルです。
次に command を使用するsbatch -p partitionname -J myjob script.shと、私のジョブは終了コード 127:0 で失敗しました。slurm-jobid.out ファイルには次のように書かれています (ロケール設定の警告は脇に置いておいてください):
/usr/share/Modules/init/sh: 2 行目: /usr/bin/modulecmd: そのようなファイルまたはディレクトリはありません /tmp/slurmd/job252624/slurm_scirpt: 10 行目: mpirun: コマンドが見つかりません
しかし、確認したところ、/usr/bin/modulecmd ファイルが存在します。
どんな提案でも大歓迎です。
編集ここでも
質問しました。
ソース ステートメントとモジュール ロード ステートメントを削除しました。
ジョブを送信する前に、ログイン ノードにモジュールをロードしようとしました。しかし、何か問題があります。次のように述べています。
moduleCmd_Lad.c(204): エラー: 105: 'intel' のモジュール ファイルが見つかりません
コマンドを使用module availして、利用可能なモジュールを確認します。
----------/usr/share/Modules/modulefiles-------------------
ドット モジュール情報 mpich2-x86_64 use.won
module-cvs モジュール null
----------/etc/modulefiles---------------------------------
compat-openmpi-psm-x86_64 compat-openmpi-x86_64
乱雑な書式設定をお許しください。
解決済み
問題は最終的に解決されます。最終的な script.sh は次のようになります。
#!/bin/bash
srun -p partitionname -n 4 -t 00:10:00 mycc
次に、コマンドsbatch -p partitionname -J myjob script.shを使用してジョブを送信します。